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在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，创建应用。 修改模板时，需填写镜像地址，获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name:
命令行工具放在D盘demo文件夹中，可以使用如下命令进入。进入后，再执行health命令即可开始使用命令行工具。如果不清楚获取路径方法，请参考图3获取路径。 cd /d d:\demo 图2 cmd窗口输入health命令 图3 获取路径 使用Linux版本命令行工具时，您需要
用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 操作步骤 添加项目成员有两种不同的方法，请任选其中一种方法操作。 方法一 单击项目名称，进入项目“设置”页。 单击“添加”，添加成员。 图1 添加成员 输入已添加至平台的用户的全称。
ndows-x86_64 ，它的校验文件下载链接则是health-windows-x86_64.zip.sha256。 详细的使用方法介绍请参见获取并使用命令行工具eihealth-toolkit。
研究对象，以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段，以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。一般包括从环境样品中提取基因组DNA, 进行高通量测序分析，或克隆DNA到合适的载体，导入宿主菌体，筛选目的转化子等工作。
submit job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 是 本地的作业模板路径。获取作业模板方法请参见作业配置文件说明。 --workflow -w 否 基于流程ID创建分析作业，可使用health get workflow workfl
-t gatk-haplotypecaller:4.1.9.0 . 详细的Dockerfile指令请参见Dockerfile参考。 上传镜像 请依据表1提供的镜像下载命令下载搭建NGS流程所需的镜像。并依据制作bwa-mem镜像和制作gatk-haplotypecaller镜像制作镜
如果进行了“靶点设置”，会自动加上相应靶点的“Binding Free Energy”才会计算对接结合能，并将对接结合能作为约束条件进行分子生成。 您可以通过“添加”来添加新的约束条件，也可以在操作列单击删除图标，删除约束参数。每个约束参数的含义参考相关参数。 强约束最多选择5个，仅Substructure和In
拷贝其他项目中的文件，将project1项目中的zip文件拷贝至本项目src1中。拷贝其他项目文件，需要是该项目的成员，并具备数据操作权限，详细权限介绍请参见项目成员和权限。 health cp project1:/test/test.zip /src1/ -r -f 父主题： 数据管理命令
开启多文件/文件夹上传模式，支持的值：[1, 2]。 如果msm=1则代表上传的URL是一组文件/文件夹列表（以英文逗号分隔）。如果文件/文件夹名本身包含英文逗号，请不要使用msm=1的模式。 如果msm=2则代表上传的URL是一个包含文件/文件夹列表的文件。 多文件/文件夹上传时必选，如果没有设置--r
系统盘 系统盘固定为40GB。 数据盘 默认为100GB，可以根据需要选择添加数据盘。 当系统盘和数据盘的总配额为3000GB时，如需增加，请联系管理员。 节点数上限 设置自动扩容的节点数上限。 取值范围为0-50。 节点数下限 设置自动扩容的节点数下限。 取值范围为0-50。 CPU执行规则
参数确认无误后，单击界面上方“启动作业”按钮，可以直接基于该流程创建分析作业。 克隆作业 克隆已有的分析作业，作业的参数及流程一并克隆到流程设计器中。克隆作业后，请修改作业的输出数据路径，否则会有覆盖原有作业数据风险。 执行克隆操作有两种方式，请选择任一方式执行。 在分析作业列表中，单击“操作”列“克隆”，进入流程设计器页面。
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