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com ... CMD 用来设置启动容器时默认运行的命令。 ENTRYPOINT 用来指定容器启动时的默认运行的命令，与CMD类似。区别在于：运行容器时添加在镜像之后的参数，对ENTRYPOINT是拼接，CMD是覆盖。 若在DockerFile中指定了容器启动时的默认运行命令为ls -l，则运行容器时默认启动命令为ls
重试作业或者删除作业出现内部异常 问题现象 启动作业立即取消作业，进行重试或者删除作业出现内部异常。 问题原因 投递作业属于异步动作，立即取消可能存在作业未完成投递，Nextflow对于不存在的作业做了静默处理。 解决方案 避免启动作业后立即取消。 克隆作业即可。 process使用errorStrategy
建议设置Docker镜像开机启动，防止出现“docker: Cannot connect to the Docker daemon at unix:///var/run/docker.sock. Is the docker daemon running?”报错。 设置Docker开机启动命令：systemctl
ID）/SK（Secret Access Key)加密调用请求。 Token认证 Token的有效期为24小时，需要使用同一个Token鉴权时，可以缓存起来，避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌（临时）的意思，拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将
PAINS： 频繁命中化合物过滤，PAINS数据库具有480个子结构。 结果解释：数值代表有多少个子结构匹配该数据库，可以通过DETAIL查看所匹配的子结构特征。 ALARM NMR Rule： 频繁命中化合物过滤，ALARM NMR数据库具有75个子结构。 结果解释：同PAINS。
SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
Nextflow是专门针对生物信息流程搭建而开发的一种框架语言，它能够很好的管理生信流程，并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用，可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移，并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型，因此不用自
的使用情况、购买记录以及购买套餐包，也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源，此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源，购买步骤参考购买资源，绑定具体操作如下： 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。
单击应用图标，弹出编辑图标，单击按钮，设置应用参数。 参数确认无误后，单击界面上方“启动作业”按钮，可以直接基于该流程创建分析作业。 通过“工具”页面创建 在“工具”页面，流程列表中，单击“操作”列“启动作业”。在弹出的作业设置页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，
流程”页签，单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节，设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默
权限，不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结：冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况，当前正在运行的分析作业会继续执行直到完成。冻结的项目可以通过“解冻”操作重新激活。
D:\local\data\test.txt /src/ --rename abc.txt 递归上传本地D:\local路径下的所有文件和文件夹至项目src文件夹中（不上传local文件夹本身）。 health upload D:\local /src/ -r -f -l 上传本地D:\local文件夹至
本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号扩起，以$符号进行引用。 fastqc软件输入参数填写为input-file、threads，输出参数为output-dir，则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令，指定运行所
“神农项目”简介 “神农项目”是完全免费公开的新冠药物虚拟筛选数据库。在抗疫期间，为了寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式，华为云医疗智能体项目团队联合多家科研机构，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过850
本。 依据FastQC命令说明填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号扩起，以$符号进行引用。 fastqc软件输入参数填写为input-file、threads，输出参数为output-dir，则镜像启动命令如下所示。 使用-t命令，指定运行所
another project. 检查引用数据库id是否为源项目的引用数据库。 400 eihealth.01040022 Data cannot be imported to a referenced database. 请选择非引用数据库进行数据导入。 400 eihealth
单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 在“RNA-Seq Analysis Based on STAR”流程操作列，单击“启动作业”，在弹出的新建作业页面，填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。
受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板：使用资产市场订阅的流程时，模板已预置，无需选择数据库模板。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为
按指定的对象名前缀批量下载，批量下载时必选。 --force -f 否 强制操作，不进行询问提示，批量下载时可选。 --flat -l 否 批量下载时，不包含上一级父对象名前缀，批量下载时可选。 --update -u 否 增量下载操作，设置该参数后，下载每个文件时会比对本地的文件，仅在以下情况时下载数据：
query-string 查询参数，可选，查询参数前面需要带一个“？”，形式为“参数名=参数取值”，例如“limit=10”，表示查询不超过10条数据。 例如，您需要获取IAM在“华北-北京四”区域的Token，则需使用“华北-北京四”区域的Endpoint（iam.cn-north-4
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