检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 * 9 大小:不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面,可以查看发布的应用状态。当应用发布成功后,可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的应用。 已发布的应用不能直接编辑和删除,需下线后才能编辑和删除。
问场景。 归档存储:适合长期存储,平均一年访问一次。 说明: 归档存储的费用为单独计费。 删除原数据 是否删除原数据。如果选择删除原数据,系统会在归档完成后统一删除已归档数据。归档后的数据可在归档中心查看或恢复。 在归档过程中请不要对归档的文件或者文件夹进行添加、更改操作,以免造成您的数据损失。
平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:如果选择的“包年包月”计费,目前只支持购买一年;如果选择的“按需”计费,无需选择购买时长。 勾选自动续费后,系统将在产品到期前自动续费,无需用户再手动操作。按月购买,自动续费周期为一个月。 单击“下一步”,确认订单详情。 单击“立即购买”,并支付订单,完成服务购买。
探针文件:探针分子建议原子数不超过400,分子量过大可以通过增大探针半径降低失败率,但无法保证一定成功。支持SDF、MOL2、PDB格式文件。若文件中含有多个配体,默认只处理第一个。 时间步长: 默认值为0.002ps,输入范围:0.001<dt<=0.002,单位:ps。分子动力学模拟的步长,建议不超过0.002ps,步长越大,越难收敛。
用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“下一步”,设置角色。 角色:支持管理员和操作员两种角色,默认为操作员。权限描述可以参考表2。 用户资源配额:设置用户的个人资源配额。详细请参考个人资源配额。
列举路径中的对象时,需使用/xxx/格式,如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时,需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用,如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如()之类的,运行的时候需要将整个路径用""括起来,或者用\将字符转义,例如:health
取值:CANCELLED,COMPLETED,FAILED,RUNNING,SUBMITTED,UNKNOWN --workflowName -w 否 流程名。此参数用于获取作业列表。 --userName -u 否 用户名。此参数用于获取作业列表。 --createStartTime -c 否
约束条件是target2_binding_energy 您可以通过“上传靶点”,将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件,提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后,运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体: 将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
上传受体:受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体:配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件,且只支持3D结构。 选择参考配体:当前自由能微扰支持自动规划路径,选择参考配体后系统自动计算,用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”,选择配体对。
析和验证,提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架,来进行下游分析或者优化等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后,系统开始进行分析,同时显示“聚类分析中”。 图5 聚类分析 待聚类分析完成后,单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图6 查看聚类结果 在聚
最小长度:1 最大长度:128 image_tag String 镜像tag名 最小长度:1 最大长度:64 profile String 系统镜像名 枚举值: PY3 表7 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度:1
LigandPreviewInfoDto objects 预览配体信息列表。 数组长度:0 - 1000 has_more Boolean 文件中是否还有更多配体没有处理;即当前数量是否表示整个文件的配体数量,若该值为false则表该配体文件含有count数量个配体;若该值为true则表示该配体文件含有大于
最小长度:1 最大长度:128 image_tag String 镜像tag名 最小长度:1 最大长度:64 profile String 系统镜像名 枚举值: PY3 表9 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度:1
ng、Pending、Failed、Cancelling、Cancelled、Unknown。 --workflow-name -t 否 流程名。 --user-name -u 否 用户名。 --job-name -j 否 任务名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihe
作业基本信息。 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 add_membrane Boolean 是否加膜处理。 缺省值:false ligands Array of LigandPreviewDto objects 配体列表。 graph FepGraphDto
创建药物作业基本信息。 receptor 是 ReceptorDrugFile object 受体文件。 add_membrane 否 Boolean 是否加膜处理。 缺省值:false ligands 是 Array of LigandPreviewDto objects 配体列表。 数组长度:2 -
blood–brain barrier Penetration,血脑屏障。作用于中枢神经系统的药物需要穿过血脑屏障 (BBB) 才能达到其分子靶点。相反,对于具有外围靶点的药物,不需要BBB渗透以避免中枢神经系统副作用,单位为cm/s。logBB 大于-1为(BBB+), logBB小于等
约束条件是target2_binding_energy 您可以通过“上传靶点”,将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件,提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后,运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体: 将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。