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作业投递后一直处于已提交的状态。 问题排查和解决方案 查看execution log, 若execution log为空,请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t be scheduled,请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock
直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时,作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”,并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的IOPS达到了上限。
动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示: 分子优化靶点设置界面,受体展示正常。 但是下载该靶点文件后,使用通用工具Mol 3D Viewer打开,会出现蛋白显示不完整的情况,如下图所示。 此时可将受体文件中的REMARK行进行删除,即可解决该问题。 父主题: 盘古辅助药物
子任务的事件 查看实例的事件,查看实例是否有正常创建。 图3 实例的事件 解决方法 若子任务未正常创建,请联系服务技术支持解决。 若子任务正常创建,但是实例未正常创建,可以通过事件信息分析,常见有以下问题场景和对应解决方案。 0/4 nodes are available: XXX Insufficient
权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据拷贝、数据删除、数据下载、数据归档、恢复数据等操作均为系统的异步任务,您可以在“消息中心”中查看任务的执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“作业
权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务,您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“数据中心
每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。 如果聚类失败,根据提示失败原因解决问题后,可单击“重新聚类分析”。 相关参数 分子属性预测的具体参数请参考相关参数。 父主题: 苗头化合物发现
每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。 如果聚类失败,根据提示失败原因解决问题后,可单击“重新聚类分析”。 相关参数 分子对接的具体参数,请参考相关参数。 父主题: 苗头化合物发现
每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。 如果聚类失败,根据提示失败原因解决问题后,可单击“重新聚类分析” 相关参数 靶点口袋分子设计的具体参数请参考相关参数。 父主题: 先导化合物优化
命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么?如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境? 如何制作镜像? 如何将生物信息学软件封装为镜像? 更多 远程登录
为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
/root/health-toolkit/下,需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行,提示Permission denied,请使用chmod 755 health命令设置执行权限。 初始化配置。 在使用命令行工具前,需要初始化配置信息。执行health
ata路径,且下载过程中不进行询问提示。 health download /src/ D:\local\data -r -f 递归下载项目中src文件夹中的所有文件和文件夹(不包含src文件夹本身)至本地data路径,且下载过程中不进行询问提示。 health download
使用已注册的华为账号登录“华为云”。 单击账号名下拉框中的“账号中心”。 进入“账号中心”页面。 单击左侧导航中的“实名认证”,选择认证类型(个人认证/企业认证),根据页面提示进行实名认证。 实名认证类型介绍 表1 实名认证详细介绍 账号类型 认证类型(任选一种类型) 详细操作指导 个人账号 推荐扫码认证(即时完成认证)
除成功时给予消息提示。 DELETE_DATA 数据删除。删除数据时给予消息提示,删除结果给予消息提示。 CLONE_DATA 数据拷贝。数据拷贝时给予消息提示,拷贝结果给予消息提示。 IMPORT_DATA 数据导入。数据导入时给予消息提示,导入结果给予消息提示。 ARCHIVE_DATA
每个结果页面只用进行一次聚类分析操作。 聚类结果是存成文件,如果文件被删或者获取不到的话会有警告, 聚类结果不存在。此时可以单击“重新聚类分析”。 如果聚类失败,根据提示失败原因解决问题后,可单击“重新聚类分析”。 相关参数 分子优化的具体参数,请参考相关参数。 父主题: 先导化合物优化
在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook Not
致)。 --force -f 否 强制操作。如果下载obsutil时,指定的obs-install-path上已经有同名文件,不带-f时会提示用户,带上-f会直接覆盖原文件。 命令示例 初始化配置 health config add -d xxx -u xxx -w xxx -i
# 提示用户参数填写的格式,取值范围:[0-64]。对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq; # 对于ENUM类型,可以提示一定要在param_e
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删,执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目,只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致,命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project