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分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)
自定义属性任务(MCP) 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
Integer 生成分子数量 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints Array of MoleculeConstraint objects 弱约束集合 num_expected
分子合成路径规划任务(MSP) 新建分子合成路径规划任务接口 查询分子合成路径规划任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
响应Body参数 参数 参数类型 描述 status String 异步任务的状态:等待中、运行中、已完成、失败 枚举值: waiting running finished failed task_data SearchTaskData object 分子搜索任务的请求体 result SearchResult
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 下载数据操作会产
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --domain-name -d 是 与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。 --user-name -u 是 子用户的用户名。 管理员(购买平台的账户)登录时,user-name和domain-name一致。 --password -w 是
分享:关闭分享后,项目内数据不允许分享给其他项目,包括拷贝、引用两种方式。 下载:关闭下载后,项目内数据不允许下载至本地。 删除:关闭删除后,项目内数据不允许通过平台、命令行工具删除。 图1 数据保护策略 数据审计 平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的写操作
Integer 生成分子数量 strong_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 弱约束集合 num_expected
Integer 生成分子数量 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints Array of MoleculeConstraint objects 弱约束集合 num_expected
使用upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台。该命令不支持将数据上传到引用目录。 最小可以上传0Byte的空文件或文件夹,最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值
高级参数:CPU需求、Memory需求、GPU类型、GPU需求,请按照使用需求进行设置;CPU架构、计算节点标签,不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时,需要您在购买平台时包含了GPU资源,并且需要应用支持GPU运行。选择D310+ARM时,需要应用支持ARM环境运行,
参数类型 描述 num_trials 否 Integer 生成分子数量 strong_constraints 否 Array of 表4 objects 强约束集合 weak_constraints 否 Array of 表4 objects 弱约束集合 num_expected 否 Integer
基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务,快速实现基因组数据分析及AI建模,提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基于基因组分
靶点化合物结合预测(CPI) 新建CPI任务接口 查询CPI任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
ADMET属性预测接口 功能介绍 计算小分子的物化性质,包括吸收(adsorption)、分布(distribution)、代谢(metabolism)、清除(excretion)与毒性(toxicity)。 URI POST /v1/{project_id}/admet 表1 路径参数
Health提供的基础镜像包制作自定义镜像,并上传至平台。您可以在EIHealth平台“开发环境”中使用此自定义镜像创建Notebook。 创建Notebook时,如果使用自定义镜像。该自定义镜像,需要基于EIHealth平台提供的基础镜像进行制作。 父主题: 镜像管理
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板,上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.tx
上传流程 通过在本地修改流程的yaml模板,上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或
所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20.1 docker pull biocontainers/fastp:v0