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线上训练得到的模型是否支持离线部署在本地? 通过ModelArts预置算法训练得到的模型是保存在OBS桶里的,模型支持下载到本地。 在训练作业列表找到需要下载模型的训练作业,单击名称进入详情页,获取训练输出路径。
AI模型 创建模型 盘古辅助制药平台支持用户创建AI模型,目前AI模型只有专业版支持。AI建模支持创建属性模型和基模型。创建属性模型是基于自定义数据,对盘古药物分子大模型进行微调,进行属性预测和迭代活性优化,实现干湿实验闭环。基模型基于自定义化合物数据,对盘古药物分子大模型进行增量预训练,提升化合物表征精度。
AI平台安装部署 ai安装包解压 将获取到的pie-engine-ai安装包复制到 Linux 操作系统计算机的某个目录下,例如 /home/PieEngine/下,执行以下命令进入该目录: cd /home/PieEngine/ 执行如下命令进行解压。
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。
wget https://www.baidu.com/img/bd_logo1.png 执行vi Dockerfile命令,进入Dockerfile文件中,编写文件。 #Version 1.0.1 FROM centos:latest MAINTAINER ***u "***u@xxx
AI平台开发与实施服务 基于华为云AI平台,结合业务场景,提供AI模型场景化建模、调优、加速、性能提升等服务。 工作说明书 常见问题 计费说明 父主题: 上云与实施
方式2:使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程,并运行作业。以二代基因组分析流程:fastp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。
什么是AI平台开发与实施服务? 华为云帮助企业快速集成ModelArts平台能力到业务应用,能够针对客户的业务场景为企业提供场景化建模咨询及模型构建服务,以及针对上线后的模型提供训练及调优服务。 父主题: 关于服务咨询
AI基因组研究 父主题: 图解医疗智能体
AI药物研究 父主题: 图解医疗智能体
如何将Notebook中的数据下载至本地 在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
欢迎使用医疗智能体服务 医疗智能体(EIHealth)平台是基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。 平台为您提供高性能、高可靠性、高性价比的计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行,提升医疗健康的服务能力和
自定义镜像创建Notebook样例 Notebook提供了在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码,在创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像。同时,您也可以使用自定义镜像,创建Notebook,满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Noteboo
EIHealth平台 应用场景 基本概念
API(AI辅助药物设计) 分子生成(MG) 分子优化(MO) 靶点化合物结合预测(CPI) 分子属性预测(MPP) 分子搜索(MS) 分子合成路径规划任务(MSP) 自定义属性任务(MCP)
获取医疗平台信息 功能介绍 获取医疗平台信息 URI GET /v1/{project_id}/system/overview 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
登录平台 主账号 登录EIHealth管理控制台。 选择华为账号登录。 图1 主账号登录 子账号 登录EIHealth管理控制台。 选择IAM用户登录。 图2 子账号登录
读取配置文件:通过json文件配置输入和输出路径。 模型训练:针对提供的数据和模型参数,AutoGenome会搜索得到最优的神经网络结构。训练过程经过模型搜索阶段和模型训练阶段,在模型搜索阶段,根据json文件中的配置参数,对于选定的模型参数会训练一定步数,搜索得到较好结果的参数进行后续训练。训练过程中可选择在验证数
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter No
登录平台方式 管理员(购买平台的账户) 登录医疗智能体管理控制台。 选择账号登录,填写账号名和密码,登录平台。 图1 登录界面 子用户(子管理员、操作员) 登录医疗智能体管理控制台。 选择IAM用户登录,填写账号名、IAM用户名、密码,登录平台。 账号名:与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。
医疗智能体(EIHealth)平台是基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源,是一站式的医疗研发平台。 医疗智能体提供以下子服务: 基因组分析 提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。
错误码(AI辅助药物设计) 当您调用API时,如果遇到“APIGW”开头的错误码,请参见API网关错误码进行处理。 表1 状态码 错误码 错误信息 处理措施 400 eihealth.03000001 invalid request data 根据错误详细信息检查请求体。 400
平台计费方式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需
基本概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分