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在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
方式3：自定义镜像运行FastQC流程 应用是运行作业的最小单位，每个应用依托于一个镜像进行创建。 方式2使用直接制作好的应用。用户也可以自己制作镜像，并基于镜像创建应用。 本示例中制作FastQC镜像，并基于镜像创建应用，运行分析作业。 镜像简介 由于生物信息学软件，往往由于不
的操作列，单击“配额设置”。 图2 配额设置 在“配额设置”页面，开启“用户资源配额”开关，填写“最大作业运行数”、“最大CPU占用核数”、“最大内存占用”、“最大作业运行时间”、“最大创建项目数”。 图3 设置参数 填写完成后，单击“确定”。 父主题： 系统设置
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。
通过设置邮箱，发送平台的通知。设置邮箱功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置邮件配置。 服务器地址：邮箱开通SMTP功能时的服务器地址，不同邮箱开通SMTP方式不同，请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址：填写邮箱地址，用于发送EIHealth平台的消息通知。
同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在作业列表中，单击对应的作业名称，可查看作业运行状态，运行时间等信息。 图13 作业运行状态 单击具体的每个应用，可以查看每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。
步骤3：新建作业 单击作业页面的“新建作业”按钮，并选择需要运行的流程。这里作业名称可以用默认的名称，也可自己更改一个名称。同时，若想比较好的方式管理输出文件，也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动
环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，ECS如果为Linux操作系统，可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
查看药筛结果 药筛运行状态可在“专题”页面查看。 图1 查看运行状态 运行完成后可单击任务名称，查看对接结合能的热图。 热图的横坐标为蛋白质名称，以及对接结合能的均值和标准差。纵坐标为配体小分子名称，数值为结合能的大小，结合能越小，颜色越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序，结合能越小代表配体和受体结合越稳定。
运行大规模虚拟药筛任务 药物数据输入格式说明 订阅Docking Summary流程 新建研究 查看药筛结果 查看药筛作业和结果下载
）或斜杠（/）或空格开头或结尾 最小长度：0 最大长度：128 resources 否 TaskResourceDto object 子任务运行资源信息 location 否 VertexLocationDto object 子任务画布坐标信息 inputs 否 Array of TaskParameterDto
最大长度：24 cpu_type 否 String cpu架构类型，不填默认X86 最小长度：0 最大长度：24 memory 否 String 内存申请使用量，取值范围[0.1-3072]，单位G，支持一位小数。对于应用，不填默认1G；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
object 更新用户请求体 表4 UserSettingDto 参数 是否必选 参数类型 描述 job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值：1 最大值：100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长，单位天 最小值：1 最大值：60 cpu_quota
子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整，一个受体配体对对接大约需要25s。 图2 运行信息 单击“提交”，运行作业。 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
oken。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度：1 最大长度：128 user_name 是 String 用户名 最小长度：1 最大长度：128 password 是 String
object 用户设置 表4 UserSettingDto 参数 是否必选 参数类型 描述 job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值：1 最大值：100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长，单位天 最小值：1 最大值：60 cpu_quota
object 用户设置 表4 UserSettingDto 参数 是否必选 参数类型 描述 job_quota 是 Integer 允许同时运行的作业数 最小值：1 最大值：100 job_timeout 是 Integer 作业执行超时时长，单位天 最小值：1 最大值：60 cpu_quota
不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 memory 否 String 内存申请使用量，取值范围[0.1-3072]，单位G，支持一位小数。对于应用，不填默认1G；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
进入资产市场订阅Docking Summary流程。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 父主题： 运行大规模虚拟药筛任务
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