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JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题： 开发环境（Notebook）
oken。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度：1 最大长度：128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度：0 最大长度：128 user_name
size分布的pdf文件。 参数填写无误后，单击界面上方“启动作业”，运行作业。 步骤4：查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业”页签，单击创建的NGS作业名称，进入详情页，查看执行结果。 图2 执行结果 作业运行完成后，单击应用进度条中的“输出参数”，可跳转至数据所在路径，获取运行结果数据。
否 表示执行更新某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个，三选一。 --delete -d 否 表示执行删除某行操作。--update、--delete 、--insert必须要传其中一个，三选一。 --insert -i 否 表示执行插入数
平台计费方式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需
策略规则 action String 执行动作 count_before_scale Integer 伸缩前节点数 count_after_scale Integer 伸缩后节点数 state String 执行状态 time String 执行时间 请求示例 查询伸缩历史 https://eihealth
haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。NGS流程执行步骤如表1所示。 表1 NGS执行步骤 步骤 描述 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 Mapping and Sort and
obsutil_checkpoint。 每个分段复制任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 批量复制时的最大并发数，
您可以在项目的应用列表中，查看隶属于该项目的应用，也可以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。 创建应用 应用是生物信息学软件的镜像封装，您可以制作软件镜像并上传至平台，并通过“新建应用”引入相关软件。
被冻结、删除、转移和分享，执行此类操作需要该项目的成员拥有相关权限。 冻结：项目当前不可用。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况。冻结的项目可以通过解冻操作重新激活。 删除中：项目删除中。需先冻结项目，才能执行删除操作。删除的核心项目，
看镜像的详细信息，执行镜像分类、添加描述、删除和查询操作。 图1 镜像管理 镜像用途 用于创建分析应用 应用是生物信息学软件的镜像封装。例如，您可将Cell Ranger软件封装为镜像，并上传至EIHealth平台。通过应用把镜像引入，利用应用搭建分析流程，执行分析作业。 用于创建Notebook
不填写项目名时，若当前所在项目是lmx-test-01，则执行如下命令后会更新当前项目中源项目为lmx-test-01的镜像demo-image的类型。 health docker update demo-image --type APP --chip ARM # 执行成功返回结果如下 update image
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit 步骤1：获取认证信息 步骤2：下载并安装命令行工具eihealth-toolkit 步骤3：初始化配置 步骤4：查看与执行操作命令
String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String 裸金属服务器的CPU架构类型 gpu_info String GPU信息 请求示例 查询计算资源规格 /v1/{project_id}/system/
作业管理 作业管理简介 创建作业 管理作业 查看执行结果 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
参数可以设置多个参数值，自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如，存在输入参数a和输入参数b，在启动作业时，分别给参数a设置了2个参数值，给参数b设置了2个参数值。那么，系统将自动生成4个作业并发执行。 对于输出参数，如果镜像启动命令中指定了输出
作业运行失败描述信息，当作业执行失败时会返回 failed_reason String 作业运行失败原因，当作业执行失败时会返回 workflow_name String 流程名称 workflow_id String 流程id command_line String nextflow执行命令 params
obsutil_checkpoint。 每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --recursive -r 否 按指定源桶的对
obsutil_checkpoint。 每个分段下载任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的down子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*
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