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obsutil_checkpoint。 每个分段上传任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的upload子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或被中断后，下次执行该分段任务时会尝试通过对应的断点记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务
项目是存储数据、镜像、分析作业等的工作空间，执行删除用户操作时，只有在该用户名下没有项目时，才可以被删除。在用户的操作列，单击“删除”，删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户，不支持删除，只支持移除。移除后不影响该用户操作其他服务。执行移除用户操作时，只有在该用户名下没
流程的服务，快速实现基因组数据分析及AI建模，提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一，基于基因组分析结果，可准确识别病毒基因特性，监测病毒变异趋势，在疫情防控、疾病诊
消息清理。消息中心的消息总和超过设置值时，进行消息清理。 表3 执行状态说明 执行状态 说明 SUCCEED 执行成功。 FAILED 执行失败。 PROCESSING 数据删除、导入等操作正在处理中。 START 项目删除操作开始执行。 RUNNING 分析作业运行中。 PENDING 分析作业等待处理中。
管理数据库 管理数据库 数据库创建完成后，您可以对数据库内的数据执行编辑、删除、新增行操作。预制数据库和引用数据库不支持编辑、删除、新增行操作。 编辑 数据库创建完成后，单击数据库名称进入数据库详情页，在页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要修改的数据行的操作列单击“编辑”，修改数据。
性操作，即要么不执行，要么需要执行过程不能中断。在执行完成后，“取消”操作才能生效。 删除：运行中的任务不支持删除，只可删除运行结束的数据。 重试：可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 图1 数据作业 复制数据 在“数据”页面，使用“复制”，将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。
以独立使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用，创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成，流程中的各个应用由其前后顺序关系形成数据流，前序应用为后序应用提供输入。医疗智
https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64.sh 安装Anaconda。 执行如下命令。 wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health
project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128 id 是 String 云服务器ID 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
像。 执行vi Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM broadinstitute/gatk:4.1.9.0 RUN apt-get update RUN apt-get install -y parallel 按Esc键，并执行:wq退出Dockerfile。
医疗智能体平台提供了REST（Representational State Transfer）风格API，支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题： 使用前必读
最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4
最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language
用详情、版本、创建者、修改和创建时间，可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。流程通过流程设计器创建，创建好的流程将存储于“项目管理”页面“工具
queue String 执行队列，使用','分隔多个值 cpus Integer 指定task执行需要的cpu数量 memory String 指定task执行需要的内存大小 disk String 指定task执行需要的磁盘大小 time String 指定task执行需要的时间 表6
oken。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度：1 最大长度：128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度：0 最大长度：128 user_name
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题： 数据管理
JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如，您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题： 开发环境（Notebook）
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