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作业配置文件说明 流程创建完成后，可基于已创建的流程运行分析作业。 在EIHealth平台，运行分析作业的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业，运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。
获取数据库模板 使用get命令获取数据库模板列表、详情或者示例yaml文件。 命令结构 health get database template <template-id> [flags] 或者 health get db template <template-id> [flags]
分子搜索作业管理 创建分子搜索作业 查询分子搜索作业详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）
安装容器引擎 容器引擎是一个开源的引擎，可以轻松的为任何应用创建一个轻量级的、可移植的、自给自足的容器。 容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装，用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境，或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。
导入流程 导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中，流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”，进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程，选择流程
邮箱设置 设置消息发送邮箱 通过设置邮箱，发送平台的通知。设置邮箱功能只有管理员用户可进行操作。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”，设置邮件配置。 服务器地址：邮箱开通SMTP功能时的服务器地址，不同邮箱开通SMTP方式不同，请使用搜索引擎查找邮箱开通SMTP方式。 邮箱地址
区建立数据中心，提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四，区域名称为cn-north-4；部署在华东-上海一，区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”，获取平台ID。
获取数据归档列表 使用get命令获取数据归档列表。 命令结构 health get archive-config # 命令中的archive-config可替换为backup-config 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linu
数据库（可选） 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能，可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
方式2：使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程，并运行作业。以二代基因组分析流程：fastp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装，将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用，不用担心复杂的开发环境问题。
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像，并将镜像上传至EIHealth平台，通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”
资产市场简介 资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区，提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用，加速基因、药物、临床应用的开发与落地，保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、
发布数据 您可以将数据发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 单击项目名称，进入项目管理页面，选择“数据”页签。 选择需要发布的数据或者文件夹，单击“操作”列的“更多>发布”。 图1 发布数据 在发布页面，填写发布数据的相关信息。
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
GSeWOUkZxjKyVBXQ75IVLJmfMmY49ixkjTyJKGYgAQfcqdwaIeN3PsOc1t0lujvFQ9eOv1pjUrSjw7YlgYbe/v0tf1AigKungHmJT9Z6PE8plyCwHKr668I5wZ2kADVMj7lhoCFP1dZU
String 作业创建时间。 finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir
虚拟药物筛选简介 虚拟药物筛选功能 医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构，计算蛋白与药物之间的结合能量，进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象，用于可视化展示。
数组长度：0 - 2 weak_constraints 否 Array of WeakConstraintDto objects 弱约束集合。 数组长度：0 - 10 strong_constraints 否 Array of StrongConstraintDto objects 强约束集合。
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
流程设计器 分析流程至少由一个应用构成，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流，一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器，您可以拖拽工具到画布中，可视化链接各应用，指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流
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