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并运行作业。以二代基因组分析流程:fastp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装,将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用,不用担心复杂的开发环境问题。 流程是由1各或者N个应用串联构建而成,平
统计消息信息 功能介绍 统计消息信息 URI GET /v1/{project_id}/messages/statistics 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
获取消息清理规则 功能介绍 获取消息清理规则 URI GET /v1/{project_id}/messages/rules 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
基本概念 应用 医疗智能体应用是生物信息软件的镜像封装,应用既可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用,创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成,流程中的各个应
Integer 通知消息总数 unread_count Integer 通知消息未读总数 notices Array of NoticeRsp objects 通知消息列表 表5 NoticeRsp 参数 参数类型 描述 id String 消息id type String 消息类型 detail
获取消息列表 功能介绍 从消息中心获取当前用户有权限查看的消息列表 URI GET /v1/{project_id}/messages 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能: 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表,查询和修改消息及完成作业保留配置,也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移项目,也可以添加、修改、移除项目成员角色。
镜像 如何搭建Docker环境? 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传?
加速”。 降低通量运行,进而降低带宽、IO需求,使得带宽、IO满足生产需求。 优化软件算法,如使用内存做缓存等,降低软件的IO需求。 针对特定的项目,对带宽或IO性能进行扩容。 提交工单或联系服务技术支持。 父主题: 流程、作业
n加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度:1
以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。 图1 使用流程 服务声明 医疗智能体服务声明,将为您介绍在使用华为云医疗智能体服务时所享有的权利、履行的义务和责任。
删除消息邮件配置 功能介绍 删除消息邮件配置 URI DELETE /v1/{project_id}/messages/email-server-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
批量删除通知消息 功能介绍 批量删除通知消息 URI POST /v1/{project_id}/notices/batch-delete 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
设置消息清理规则 功能介绍 设置消息清理规则,支持修改记录数(1W-1000W) URI PUT /v1/{project_id}/messages/rules 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
是 Array of strings 批量更新通知消息id列表 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:1 - 50 operation 是 String 通知消息操作 枚举值: read 响应参数 无 请求示例 批量更新消息状态为已读 https://eihealth.cn-north-4
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 scope String 接收范围(不接收消息(none)、仅接收自己操作的消息(mine)、接收全部消息(all)) resource_types Array of strings 资源类型 language String
选择CPU、GPU类型和大小,选择内存大小,内存单位为GB。 CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0
获取消息中心消息列表 使用get命令获取消息中心消息列表。 命令结构 health get message [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --message-type -m 否 消息类型,根据消息类型筛选消息列表。 --resource-type -r
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题: 系统管理
"conda_py37" 使用新生成的Notebook kernel。 在Files页面,选择新建的Notebook kernel。 安装新软件包。 查看pandas是否安装。如下表示 pandas未安装。 返回Terminal,切换到相应的环境“py37”,然后安装pandas。