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虚拟药物筛选简介 虚拟药物筛选功能 医疗智能体平台支持根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构，计算蛋白与药物之间的结合能量，进而预测小分子是否有成为候选药物的可能性。 虚拟药物筛选可实现如下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。 整合受体与分子对接产生的配体构象，用于可视化展示。
进行资源的隔离和访问控制，不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 预置数据库和模板 平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据库和药物配体注释信息数据库，并提供对应的数据库模板。您可以在“数据库”页签单击“shennongProject-database”和“ligand
区，提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用，加速基因、药物、临床应用的开发与落地，保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。您可以查看各类资产的详细介绍和使用方法，并订阅资产至项目中使用。
文件来源包括数据中心和示例数据。 手动输入：输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行，每行最多输入1024个字符，SMILES不支持输入空格或者中文。 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。
单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，在“权限”列重新设置项目成员角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图3 移除、修改项目成员 选中成员，单击操作列“移除”，将成员从项目中移除。 成员角色和权限 在项目中，成员可以划分为5种不同的角色。详细角色介绍请参考表 项目成员角色。
项目成员和权限 医疗智能体以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。
数据的上传和下载 在Notebook页面，可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
修改供应商logo和名称配置 使用update或edit命令修改供应商logo和名称配置。 命令结构 health edit vendor-config [flags] 或者 health update vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc
系统配置和供应商配置 查询系统配置列表 获取供应商配置 设置供应商配置 获取跨域归档配置 修改跨域归档设置 父主题： 系统管理
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置，默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
64]，允许大小写字母、数字、空格、下划线(_)和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度：5 最大长度：64 labels 否 Array of strings 标签，取值范围[0,5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照Fa
of integers 分子量范围。 最小值：1 最大值：1000 数组长度：2 - 2 optimization_mode String 优化类型。 枚举值： generation side_chains_decoration scaffold_hopping fragment_growing
将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 功能介绍 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/toolkit/complex-combine
"current_region" : true } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题： 系统配置和供应商配置
ve-configs/{region_id} 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题： 系统配置和供应商配置
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选择“可用区”、“计算规格”、“系统盘”、“数据盘”、“计费模式”、“购买时长”、“购买数量”。 图2 购买计算资源 可用区：选择可用区。 计算规格：分为通用计算增强型、内存优化型、BMS计算型、磁盘增强型、超大内存型、GPU加速型，根据需求选择类型，并勾选规格名称。 系统盘：40GB，不可修改。 数据盘：数据盘可
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