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NGS流程简介 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时,大幅地提高了测序速度,有力推动了相关研究。目前,NGS已广泛应用于全基因组测序、外显子测序、表观遗传学修饰等重要的生物学问题。
t-Token的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 force 是 Boolean 是否强制终止,默认为false 缺省值:false 响应参数 无 请求示例 终止作业,启用强制终止模式,即运行中的步骤也会被终止。 https://eihealth
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述
t-policies 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述
--io-acc-id -c 否 IO加速实例id,为空则不开启IO加速,设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为:auto_schedule,则会自动调度加速包,当id设置为local_disk,则开启本地盘加速。 --nodeLabels -l
Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表14 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower Number 值域下限 lower_inclusive Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限
计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业
Boolean 模型推理是否呈现置信区间 表13 ValueRange 参数 参数类型 描述 lower Number 值域下限 lower_inclusive Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限
# 参数是否必须,取值[true,false] concurrent: vars_iter # 是否并发,取值 vars_iter 时为开启并发状态,不设置则不开启 description: ''
在“项目列表”中,展示了当前用户有权限访问的项目,以及项目大小、项目成员角色、所有者、状态、是否核心项目、创建时间、更新时间和可执行的操作。 图2 项目列表 查看项目详情 项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。 查看项目概览 单击
参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required 是 Boolean 参数是否必须 concurrent 否 String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 最小长度:0 最大长度:16 type 是 String 参数类型。取值:
体水平上的缺失或扩增性突变,因此Copy Number Variation(CNV)可以作为检测是否患癌的指标。本流程使用患者的NGS测序数据,进行CNV变异筛查,进而判断取样者是否有患癌风险。 该流程以CNVkit为核心,基于输入的fastq,以hg38人基因组数据生成的参考基
路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述
参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required 是 Boolean 参数是否必须 concurrent 否 String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 最小长度:0 最大长度:16 type 是 String 参数类型。取值:
计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业
64 表4 DatabaseTriggerDto 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 触发器的列名,取值范围:[1,63] 最小长度:1 最大长度:63 judge_mode 是 String 触发器的判断模式 枚举值: gte lte gt lt like notlike
参数描述。取值范围:[0-255] 最小长度:0 最大长度:255 required Boolean 参数是否必须 concurrent String 参数是否开启并发。当前支持vars_iter并发类型,不填表示未开启并发。 最小长度:0 最大长度:16 type String 参数类型。取值:[ST
请检查项目ID是否正确。 404 eihealth.01020004 The image does not exist. 请检查镜像ID是否正确。 404 eihealth.01020005 The image tag does not exist. 请检查镜像tag是否正确。 404
您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身,使用“\?”代表匹配“?”字符本身。首先执行exclude的匹配规则,如果待移动的对象名不匹配exclude,则判断待移动的对象名是否匹配该参数,如果匹配则移动该对象,否则跳过该文件的复制。 建议使用引号传递该匹配模式(macOS/Linux操作系统使用单引号,W