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有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 输出个数:输出个数越多,任务时间越长。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格,首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。
0c00821 查看“神农项目”药物筛选结果 登录EIHealth平台,可在“专题”页签中查看“神农项目”药物筛选结果。可参考视频介绍了解详细的使用指导。 在图2中,页面最右侧显示结合能的最大值和最小值,以及对应的列名称、行名称。 单击列名称或行名称,在弹窗中单击图标,可以对结合能数据进行排序。
存储资源列表 表4 StorageResourceRsp 参数 参数类型 描述 spec SpecDto object 规格信息 size Long 使用量 charge_mode String 计费模式 create_time String 购买时间 status String 状态 表5
1核为100m,单位为"C" 最小值:1 最大值:128 缺省值:1 gpu Float notebook占用的gpu,0.1为使用单卡10%,1为占满单个显卡,1+为使用多个显卡 最小值:0 最大值:16 缺省值:0 memory Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值:2
1核为100m,单位为"C" 最小值:1 最大值:128 缺省值:1 gpu Float notebook占用的gpu,0.1为使用单卡10%,1为占满单个显卡,1+为使用多个显卡 最小值:0 最大值:16 缺省值:0 memory Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值:2
将不能进行资源访问,保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值,数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态,且资源不再使用,您可以进入EIHealth控制台,在操作列的“更多”中手动删除或释放平台。 图1 删除平台(按需计费) 图2 释放平台(包年包月计费) 话单延迟导致欠费
响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 dev_user_pool Boolean notebook是否使用专属资源池 has_dev Boolean 是否集成开发环境 has_drug Boolean 是否部署药物虚拟筛选 has_encryption_button
对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后,您就可以使用Token认证调用其他API。 图1 获取用户Token响应消息头 响应消息体 响应消息体通常以结构化格式返回,与响应消息头中Conten
202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 订阅资产市场数据,资产数据版本为v1.0,使用覆盖模式,目的目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pro
况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821),并搭建虚拟药物筛选数据库。
名称”中修改模板名称,单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板,您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库模板支持yaml或yml格式,且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”,单击“下载示例文件”下载数据库模板示例,编辑后上传模板文件至平台,单击“确定”。
执行归档操作时,若包含禁止删除的文件或文件夹,并打开了删除原数据开关,则被设置为禁止删除的文件或文件夹会删除失败,其他文件或文件夹删除正常。 使用obsutil上传数据,必须加full controle,否则会导致归档失败。 归档作业取消后,不支持重试。 选择归档类型为归档存储后,对
添加流程文件 添加完成后,单击“下一步”,配置流程参数。 添加参数方式支持两种,一种为单击进行添加,一种为单击进行添加。如果参数比较多,建议使用“上传参数”方式。 上传参数方式:支持json或yaml格式,文件大小不能超过10M。模板可以通过单击进行下载。如果上传参数有重名的参数,则只取最后一个参数的值。
String 磁盘类型 space Integer 磁盘大小,单位GB encrypt Boolean 是否加密 used Double 磁盘已使用量,单位GB 请求示例 查询数据库资源列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v
设置成功后,单击“确定”。 项目存储量15分钟刷新一次,如果设置了项目最大存储量,项目数据达到最大存储量后,数据上传、复制、导入、执行的作业、notebook的使用会失败。 父主题: 项目管理
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 数据库名称,长度为5-32个字符,首位需以小写英文字母开头,仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。 最小长度:5 最大长度:32 description 否 String 数据库描述。 最小长度:0
探针半径:控制产生的离散点到表面原子的距离。默认值为1.4 ,输入范围: 1.4-5,单位:Å。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格;首位只能以数字或字母开头。 标签:设置任务标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 单击“提交”。
效。 删除:运行中的任务不支持删除,只可删除运行结束的数据。 重试:可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 复制数据 在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。
workflow_file_url String 流程的文件名下载地址 main_file String 主文件名 params_file String 用户上传时使用的参数文件名 params Array of NextflowParamsDto objects 流程参数列表 create_time String
CPU架构依赖于制作镜像过程中选择的系统类型,以及制作镜像时所需的生物信息学软件支持在X86还是ARM上运行。例如,GATK是基于X86指令集开发的生信软件,使用CentOS的X86系统创建GATK镜像,则在创建应用时选择“X86”。 CPU需求:请按实际需求填写,取值范围为“0.1-128”,单位C,支持一位小数,不填默认1C。