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例如,使用health switch project ngs-project命令进入到名为ngs-project的项目中。 使用命令行工具,用mkdir命令创建存储数据的文件夹。 例如,使用health mkdir input-data命令创建名为input-data的文件夹。 将本地数据上传至项目文件夹中。
summary:汇总分子对接结果。 图4 数据路径和流程图 图5 设置数据库 设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,允许取消、强制停止或删除。 图6 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详细的3
API(盘古辅助制药平台) CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理
Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 space 是 Integer 存储空间,单位GB 最小值:1 最大值:327680 count 是 Integer 购买数量 最小值:1 最大值:10 响应参数 无 请求示例
响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 平台ID 最大长度:64 storage Long 存储量,单位:byte project_num Integer 项目总数 charge_mode Integer 计费模式 is_arrears
参数类型 描述 spec_code 是 String 规格编码 最小长度:1 最大长度:128 disk_space 否 Integer 磁盘存储空间,该字段暂不生效 最小值:40 最大值:1000 disk_encrypt 是 Boolean 磁盘是否加密 响应参数 无 请求示例
object notebook镜像信息 storages Array of NotebookStorage objects notebook存储信息 create_time String notebook创建时间 update_time String notebook更新时间 failed_message
logs Array of LogContentDto objects 作业日志内容列表 log_storage_link String 作业日志存储链接 表5 LogContentDto 参数 参数类型 描述 collect_time String 作业日志采集时间 content String
Integer 核数 ram Integer 内存 max_connections Integer 最大连接数 disk_space Integer 存储空间 sold_out Boolean 是否售罄 请求示例 获取数据库资源规格列表 https://eihealth.cn-north-4
在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。 GitHub获取:可以选择版本,目前支持选择的安装包版本v22.10.6,v22.10.0,v22.04.0。 上传安
object notebook镜像信息 storages Array of NotebookStorage objects notebook存储信息 create_time String notebook创建时间 update_time String notebook更新时间 failed_message
参数类型 描述 id String 已绑定的集群id。 name String css集群名称。 storage Integer css集群总存储。 import_time String css集群导入时间。 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" :
作业执行超时时长,取值范围: [1, 144000],单位:分钟,默认数值1440 最小值:1 最大值:144000 output_dir String job结果存储目录,不指定则在workflow的工作目录下生产job同名子目录,指定则以指定路径为准 status String 作业状态 create_time
输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在作业中心页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图 输出结果除了支持上图所示的列表视图外,还支持卡片式图和3D视图。
数据发布成功后,可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的数据。 已发布的数据不能直接编辑和删除,需下线后才能编辑和删除。 发布中的数据可以取消,取消后状态为发布失败。 已发布的数据可以订阅和下线。 同一个发布者可以发布同名称,同类型的数据,若版本不同,则合并。用户在使用时,可以选
镜像发布成功后,可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的镜像。 已发布的镜像不能直接编辑和删除,需下线后才能编辑和删除。 发布中的镜像可以取消,取消后状态为发布失败。 已发布的镜像可以订阅和下线。 同一个发布者可以发布同名称,同类型的镜像。若版本不同,则合并。用户在使用时,可以选
genomeagent镜像 使用genomeagent镜像 genomeagent镜像功能点介绍 父主题: 资产市场
盘古辅助药物 为什么下载的部分靶点文件,显示不完整 CSS常见问题
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题: 功能模块
功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)