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归档路径集 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:1 - 50 storage_type 否 String 存储类型,可选择标准(STANDARD)或归档存储(COLD) 枚举值: STANDARD COLD delete_archived_data 否 Boolean 是否删除已归档数据
选择自定义镜像。 工作环境 选择已上传的自定义镜像。 CPU 设置CPU大小。 GPU 设置GPU大小。 内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在N
是否删除已归档数据(默认false)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --storage-type -s 否 归档的存储类型,支持STANDARD和COLD。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程。 health create backup
平台通过云审计服务(CTS)提供操作记录的收集、存储和查询,审计操作可以设置导出用户的写操作(默认)和读操作(可选),保存周期可以设置需要保存的审计日志的保存周期,下载按钮可以下载最近7天内最新的1万条数据审计日志,查看按钮可以查看及下载保存的审计日志。 通过审计日志可用于支撑安全分析、合规审计、资源跟踪和问题定位等
数据的上传和下载 在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
ReceptorDrugFile object 受体文件。 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。
简介 Nextflow是专门针对生物信息流程搭建而开发的一种框架语言,它能够很好的管理生信流程,并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用,可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移,并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的
详情、版本、创建者、修改和创建时间,可以对名称、创建者、修改时间、创建时间、源项目进行排序。并可执行查询、修改和删除应用的操作。 图1 应用列表 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。流程通过流程设计器创建,创建好的流程将存储于“项目管理”页面“工具”
项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过划分角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 父主题:
是否显示加密按钮 deploy_mode String 医疗智能体部署模式 enable_cold_archive Boolean 是否支持归档类型存储 public_bucket_path String 医疗智能体公共数据桶https路径 请求示例 查询系统配置列表 https://eihealth
选择“genomeagent”镜像。 CPU 设置CPU为4.0核。 GPU 设置GPU为0。 内存 设置内存大于8G。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在N
128],gpu规格默认0,范围[0,16],memory规格默认2G,范围[2,512]。 --storage-path -s 是 notebook存储路径。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 格式为ProjectName:/path,多个路径用分号(;)隔开。 --project
数据管理常用操作 复制数据 下载数据 删除数据 查看3D 执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限,详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、
cold type bucket. 不支持引用归档存储类型的桶,请选择其它类型的桶。 403 eihealth.01030030 The operation of cold type data is not supported. 请选择非归档存储的文件。 403 eihealth.01030034
100000000] 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 降序或升序(分别对应desc和asc,默认为desc) 缺省值:desc sort_key 否 String 排序字段(支持type, end_time) 请求参数 表3
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题: 用户指南(基因平台)
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 获取模板列表 health get db template # 返回结果如下 Template
复制数据 解除引用 下载数据 禁止/允许删除数据 删除数据 恢复数据 执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限,详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据
命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用health get app -s命令获取模板,详细的模板介绍和使用请参见获取应用模板。 使用health get app命令查询指定应用信息。 health
运行完成后可单击任务名称,查看对接结合能的热图。 热图的横坐标为蛋白质名称,以及对接结合能的均值和标准差。纵坐标为配体小分子名称,数值为结合能的大小,结合能越小,颜色越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序,结合能越小代表配体和受体结合越稳定。 单击结合能数值,可查看详细对接结果。 第1部分描述了蛋白