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可自定义数据库,以用户输入的参考化合物结构为起点,可以按照相似度或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子:
上传大于1GB数据 当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
取消或强制停止作业调度 功能介绍 取消或强制作业调度 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/terminate 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
必须以大小写字母或数字结尾。更新流程时,流程名称不支持修改。 version: '1.0.0' # 流程版本,取值范围[1,24],以小写字母或数字或大写字母开头,允许出现中划线,必须以大小写字母或数字结尾。更新流程时,流程版本不支持修改。
说明 ID 无 否 不选此参数时,列出当前所在项目的所有应用信息。 指定app-id或app-name:version:srcproject,列出具体应用的信息,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。
String 应用名称 目标应用名称 取值范围:长度为[1,56],以大小写字母开头,允许出现中划线(-)、下划线(_)、小写字母和数字,且必须以大小写字母或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 应用版本 取值范围:[1,24],以小写字母或数字或大写字
、8。 GPU需求:请按实际需求填写,只能输入0到16的正整数。 计算节点标签:请选择标签名称,不支持多选。应用将会调度到有相应节点标签的计算节点。计算节点标签设置方法请参见计算资源标签管理。 填写输入参数、输出参数。 参数填写时,输入参数及输出参数有字符串(String),文件
包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 output_dir_type 否 String 输出路径的类型 node_labels
job_name String 作业的名称,取值范围:[1,63],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-) job_name_type String 作业的名称类型 job_description String 作业的描述,取值范围:输入字符最大长度为255 最小长度:0 最大长度:255
GB。支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式。文件来源包括数据中心和示例数据。 手动输入:输入小分子SMILES表达式。最多支持输入1000行,每行最多输入512个字符,SMILES不支持输入空格或者中文。 选择基模型:选择基模型,此参数只有专业版支持。基模型列表见AI建模。
String 应用名称 目标应用名称 取值范围:长度为[1,56],以大小写字母开头,允许出现中划线(-)、下划线(_)、小写字母和数字,且必须以大小写字母或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 应用版本 取值范围:[1,24],以小写字母或数字或大写字
String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 自定义属性名称 最小长度:1 最大长度:32 description 否 String 自定义属性描述信息 最小长度:0 最大长度:256 type 是 String 属性预测类型
使用“导入应用”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入应用”,进入导入应用页面。 图1 导入应用 选择需要引用的项目以及项目中的应用,选择应用的版本。“导入应用名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”,导入应用,导入过程中可以查看每个应用的导入状态。
project-name 无 否 要更新的镜像的源项目名称,不填写时默认为当前所在的项目。 image-name 无 是 要更新的镜像名称。 --type -t 否 镜像类型,只支持APP或者NOTEBOOK。 --description -d 否 镜像描述。当描述中带有空格时,需要添加引号来获取完整的描述信息。
属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name 否 String 属性名称 最小长度:1 最大长度:32 type 否 String 属性类型 枚举值: binary numerical description 否 String 属性具体描述信息 最小长度:0 最大长度:256
应用的ID(app-id),使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称(app-name:version:srcproject),srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。
属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name 否 String 属性名称 最小长度:1 最大长度:32 type 否 String 属性类型 枚举值: binary numerical description 否 String 属性具体描述信息 最小长度:0 最大长度:256
修改指定workflow内容(名称不支持修改)。 命令结构 health nextflow edit workflow ID [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。
使用“导入流程”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”,进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入流程 单击“确定”,导入流程。 父主题:
属性业务侧ID 最小长度:1 最大长度:128 name 否 String 属性名称 最小长度:1 最大长度:32 type 否 String 属性类型 枚举值: binary numerical description 否 String 属性具体描述信息 最小长度:0 最大长度:256