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、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用，并进行修改、删除、查询、导入操作。 流程管理 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义，流程至少由一个应用组成。 您可以使用该工具创
为防止资源滥用，平台限定了各服务资源的配额，对用户的资源数量和容量做了限制。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要，您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下： 统一身份认证（IAM） 容器镜像服务（SWR） 对象存储服务（OBS） 关于如何查看配额，如何申请扩大配额，请参见“《用户指南》
获取镜像 获取创建分析应用的镜像 创建分析应用时，您可以通过Docker Hub等镜像仓库，搜索引擎，自己制作等途径获取所需的镜像。 例如，可在Docker Hub获取bwa软件（用于将基因序列比对到参考基因组上）。 以下类型镜像，建议您通过Docker Hub获取，不建议自己制作。
）是配套EIHealth平台，为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具，可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。
）是配套EIHealth平台，为EIHealth平台各功能组件提供命令行管理工具。借助此工具，可以辅助您对EIHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 eihealth-toolkit具备灵活性高、扩展性强： 单一可执行文件，方便拷贝与安装。 支持多操作系
在作业列表中，单击对应的作业名称，可查看作业运行状态，运行时间等信息。 图13 作业运行状态 单击具体的每个应用，可以查看每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径，可以跳转至输出文件位置。
然后单击“高级 > 继续前往xxxx（不安全）”，页面显示“403 : Forbidden”，然后返回Notebook列表页面。 请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操作界面，在Notebook列表中，选择已经创建的Notebook，单击“操作”列的“打开”，进入Notebook开发页面。
件会保存在该目录，请确保运行obsutil的用户对该路径有写权限。该路径的可用空间需要大于待下载对象的大小。 --dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的下载操作。 --vlength -v 否 下载完成后，验证本地文件大小是否与桶中对象的大小一致。 --vmd5 -M
盘古辅助制药平台 应用场景 基本概念
导入流程 导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中，流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”，进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程，选择流程
参数可选。 --arcDir -g 否 同步上传文件成功后的归档路径，上传成功后的文件会移动到该本地路径下。 --dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的上传操作。 --link -k 否 上传软链接文件/文件夹指向的真实路径。 如果未指定该参数，而待上传的文件是一个软
增量复制，设置该参数后，复制时会判断是否有同名文件，若有同名文件，则跳过不进行复制。 --fr -R 否 复制对象时生成结果清单文件。 --dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的复制操作。 --crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式，以通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶，且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。
移动对象时生成结果清单文件。移动对象时该参数可选 。 --flat -l 否 移动时，不包含上一级父对象名前缀。批量移动时该参数可选 。 --dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的移动操作。 --update -u 否 增量移动操作，设置该参数后，移动每个源对象时会对比目标桶中对应路径的目标对象
EIHealth平台 应用场景 基本概念
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
API（医疗智能体平台） 项目管理 系统管理 数据管理 数据库管理 应用管理 资产市场 notebook开发环境 Nextflow接口
若确实存在路径需要包含多个文件或目录，可参考如下方案解决。 以下图为例，首先调整应用的输入参数为input-a和input-b，分别表示两个路径存在包含关系的目录（/test/sub和/test ）。 然后修改应用的镜像启动命令如下即可。 cp -rf ${input-a} ${output};
系统标签管理 在平台右上角用户名中选择“标签管理”。 系统标签用于设置项目、应用、流程、作业分类，系统管理员可以在系统标签管理中添加、删除、批量删除标签。 图1 系统标签管理 添加标签 在“标签管理”页面，单击“添加”。 在“添加标签”弹窗中，输入标签名称、标签描述。 标签名称长
上传对象时生成结果清单文件。 --arcDir -g 否 上传文件成功后的归档路径，上传成功后的文件会移动到该本地路径下。 --dryRun -y 否 测试模式运行，不执行实际的上传操作。 --link -K 否 上传软链接文件/文件夹指向的真实路径。 如果未指定该参数，而待上传的文件是一个软
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
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