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求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 report_files Array of
在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
String 模型数据文件来源。 枚举值： public private url String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id，仅文件为数据中心时填写。
创建容器应用基本流程 05 实践 基于EIHealth平台，搭建NGS流程，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 基于二代测序的基因突变检测 NGS流程简介 操作步骤 快速创建一个kubernetes集群
加速效率：IO加速>本地盘加速>无 无：作业运行于OBS中，不使用加速。 IO加速：IO加速使用弹性文件服务（SFS）提供高性能的数据读写，作业运行时，会将非最终结果的数据存储在SFS中用以提高任务运行效率，作业执行完成后会清理释放SFS空间。对于涉及频繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。
图8 查看作业信息 聚类分析 目前靶点口袋分子设计返回的结果小分子数较多，无法进行批量分析，通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游的分子优化、合成路径规划等。 在输出
基因组变异检测 基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和sam
finish_time String 作业结束时间 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回 failed_reason String 失败原因，当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称 tool_info ToolInfoDto
运行详情。 失败：作业运行失败。可单击作业名称，进入详情页查看运行失败原因。 取消中：对“运行中”的作业，执行“取消”操作，取消运行。 已取消：取消运行成功。 强制取消：对于超时失败或者取消但未选择强制取消的场景，可以执行强制取消，强制作业。 查看执行状态 您可以通过单击作业名称
在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面，选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。 单击“测试链接”验证用户名或密码无误后单击“确定”，即可完成绑定（可选项）。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口 图2
是 String 用户id 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作
参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头，从而通过身份认证，获得操作API的权限，获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768
会同步到OBS中，如图2所示。 图2 通过OBS同步数据 “Upload”上传数据大小受限时，您可以通过以下多种方式将文件上传到OBS中，通过OBS与Notebook进行数据同步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据，支持上传最大为1GB的单个文件。
场>组织共享”中查看发布的镜像。 已发布的镜像不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。 发布中的镜像可以取消，取消后状态为发布失败。 已发布的镜像可以订阅和下线。 同一个发布者可以发布同名称，同类型的镜像。若版本不同，则合并。用户在使用时，可以选择对应的版本号进行订阅或者下线。若版本相同，则更改版本后发布。
创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照FastQC的调用命令设置参数和镜像启动命令。 图1 FastQC命令 父主题：
图14 查看作业信息 聚类分析 目前分子对接返回的结果小分子数较多，无法进行批量分析，通过一些聚类的 辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游的分子优化、分子属性预测、合成路径规划等。
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
同步到OBS中，如图 通过OBS同步数据所示。 图2 通过OBS同步数据 “Upload”上传数据大小受限时，您可以通过以下多种方式将文件上传到OBS中，通过OBS与Notebook进行数据同步。 表1 上传数据方法 上传方法 说明 “数据”页面上传 通过“数据”页面上传数据，支持上传最大为1GB的单个文件。
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
附录 状态码 错误码（医疗智能体与盘古辅助制药平台） 错误码（AI辅助药物设计） 获取项目ID 配置OBS访问权限
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