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程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。配置信息导入后，即可查询命令行工具支持的操作，并执行相关命令，使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。 执行health --help查询支持的操作命令。Linux系统下，需添加./指定当前路径。
在使用该命令前，您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 项目名称，在EIHealth平台创建项目时，由用户填写。 指定具体项目名称时，返回此项目的详情信息。
购买CSS资源 登录CSS云搜索服务。 单击“创建集群”。 图1 创建集群 基础配置：选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”，输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格：参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs
持显示引用的其他项目的数据。 在使用该命令前，需要使用switch命令进入待操作的项目，才可以执行数据相关操作，使用逻辑与EIHealth平台相同。 命令结构 health ls <path> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 path 无 否 路径名称。
2.txt;projectname:/test3.txt" } } --output_dir -o 否 输出路径（EIHealth平台数据路径）。可自定义。不指定时，按照“作业名称+UUID”格式自动生成存放输出结果的目录。输出路径只能以/开头，不能以/结尾。 --timeout
传输请求的协议，当前所有API均采用HTTPS协议。 Endpoint 承载REST服务端点的服务器域名或IP，不同服务在不同区域时，对应Endpoint不同，可以从终端节点中获取。 例如EIHealth服务在“华北-北京四”区域的Endpoint为“eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
数据管理简介 EIHealth平台使用对象存储服务（OBS）存储原始数据、流程执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分，从项目角度进行数据的管理，不同项目的数据可以通过“导入数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
q文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health switch project
目前，NGS已广泛应用于全基因组测序、外显子测序、表观遗传学修饰等重要的生物学问题。 本示例中NGS流程基于医疗智能体（EIHealth）平台搭建，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。
Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合，将不同结构叠合在一起，用于比较结构差异。
或上传的配体所占空间及相应Padding空间扩展值确定口袋的中心及大小。 选择残基 选择残基方式由用户点选多个平台识别到的残基定义口袋的位置。 自动预测 自动预测通过平台内置的蛋白口袋预测算法为用户提供多个可选择的口袋位置。 自定义 自定义则由用户通过指定口袋的中心位置及大小确定口袋位置。
下载数据 在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面，展开数据文件夹，选择待下载的数据。
的定制并行执行的样本数目，大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体（EIHealth）平台集成了Nextflow框架，支持用户直接在医疗智能体（EIHealth）平台安装Nextflow。 父主题： Nextflow
标签管理 在平台右上角用户名中选择“标签管理”。 系统标签用于设置作业分类，可以在系统标签管理中添加、删除标签。 添加标签 在“标签管理”页面，单击“添加”。 在“添加标签”弹窗中，输入标签名称、标签描述。 标签名称长度为1~32，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。
数据管理简介 盘古辅助制药平台使用对象存储服务（OBS）存储原始数据、作业执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分，从项目角度进行数据的管理，不同项目的数据可以通过“复制数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
在EIHealth平台，创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出，对于由多个应用搭建出来的流程，命令行工具中通过指定不同应用间的输入输出关系，完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程，创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源，购买步骤参考购买资源，绑定具体操作如下： 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面，选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。
、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 产品介绍 用户指南 仅两个按钮时选用 立即使用 成长地图 由浅入深，带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体（EIHealth）面向基因组分析、药物研发、临床研究三个领域，提供专业的AI研发平台，让科研过程标准化、可执行。 产品介绍
除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务，您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时，平台针对该类任务支持您在“数据中心 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面，支持通过作业类型、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。
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