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创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 存在一个创建好的项目。 单击项目名称后面,进入项目设置页。 选择“成员管理”,单击“添加成员”。 图1 添加成员 选择已添加至平台的成员名称及权限。 图2 选择成员 单击“确定”,将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 单击项目名称后面,进入项目设置页。 选
看运行详情。 失败:作业运行失败。可单击作业名称,进入详情页查看运行失败原因。 取消中:对“等待中”的作业,执行“取消”操作,取消运行。 已取消:取消运行成功。 父主题: 作业管理
smiles 是 String 分子SMILES表达式 custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1
CSS集群列表。 count Integer css集群总数。 表5 CssClusterDto 参数 参数类型 描述 id String 已绑定的集群id。 name String css集群名称。 storage Integer css集群总存储。 import_time String
迅速成立联合团队,从新冠病毒蛋白序列开始,针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取靶点蛋白的3D结构,对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而
看运行详情。 失败:作业运行失败。可单击作业名称,进入详情页查看运行失败原因。 取消中:对“运行中”的作业,执行“取消”操作,取消运行。 已取消:取消运行成功。 强制取消:对于超时失败或者取消但未选择强制取消的场景,可以执行强制取消,强制作业。 查看执行状态 您可以通过单击作业名
归档存储:适合长期存储,平均一年访问一次。 说明: 归档存储的费用为单独计费。 删除原数据 是否删除原数据。如果选择删除原数据,系统会在归档完成后统一删除已归档数据。归档后的数据可在归档中心查看或恢复。 在归档过程中请不要对归档的文件或者文件夹进行添加、更改操作,以免造成您的数据损失。 选择归档数据
多家科研单位,从新冠病毒蛋白序列开始,针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,获取的结合能信息均公开在“神农项目”中。 图1 “神农项目”药物虚拟筛选数据库
存储类型,可选择标准(STANDARD)或归档存储(COLD) 枚举值: STANDARD COLD delete_archived_data 否 Boolean 是否删除已归档数据 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 归档数据,归
binding_site BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 GenerationResult 参数 参数类型 描述 name String 任务名 最小长度:1 最大长度:128
binding_site BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 OptimizationResult 参数 参数类型 描述 name String 任务名 最小长度:1 最大长度:128
响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String study作业id 请求示例 创建药筛作业,指定已创建的流程作业id、数据库模板id、数据库名称、生成结果的相对路径、输出文件类型 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板:使用资产市场订阅的流程时,模板已预置,无需选择数据库模板。 数据库名称:数据库的名称。 输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
start_time String 归档开始时间 end_time String 归档结束时间 archive_days Integer 已归档天数 size Long 大小 description String 归档描述 operator_name String 归档人员姓名 请求示例
如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库,可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下: 可用:数据库正常,可以进行分子搜索使用。 等待中:数据库创建任务正在等待。 创建失败:数据库创建失败。
Integer 期望最大返回条目数(排序后取Top) custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1
续订、退订资源 勾选已购买的资源,在页面上面单击“续订”或“退订”。 图14 续订或退订资源 释放资源 当购买的资源处于冻结状态时,可以选择释放资源。勾选已购买的资源,在页面上面单击“释放”。 图15 释放资源 删除资源 购买资源时选择按需计费模式,如果资源不再使用,可以删除资源。 在已购买资源的“操作”列,单击“删除”。
联合多家科研单位,从新冠病毒蛋白序列开始,针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化,获取靶点蛋白的3D结构。对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,同时从21个蛋白的角度,综合、无偏的评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。
数据路径和流程图 图4 设置数据库 设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,单击图标,允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败”的任务,单击图标,允许修改任务参数,再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计
初始化分子集合 binding_site 否 表6 object 结合位点 custom_props 否 Array of 表8 objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 MoleculeConstraint 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 属性名称 type