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success Boolean 相似度计算是否成功。 similarity Float 配体对之间的相似度。 最小值：0 最大值：1 reason String 相似度计算失败的理由。 最小长度：1 最大长度：512 请求示例 无 响应示例 状态码： 200 查询配体相似性图计算任务成功响应。
false } ] } 响应示例 状态码： 201 配体相似度图任务创建成功响应。 { "id" : "c05ebc2029c24699af2354f67391604c" } 状态码 状态码 描述 201 配体相似度图任务创建成功响应。 错误码 请参见错误码。 父主题： 药物通用接口
删除配体相似性图计算任务 功能介绍 删除配体相似性图计算任务。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/similarity-graph/{task_id}
输入小分子。最终以SMILES为准。 选择算法：可以选择ECFP4 Tanimoto相似度或者骨架搜索。ECFP4 Tanimoto相似度是通过ECFP4指纹计算Tanimoto相似度来搜索相似度比较高的小分子。骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。 选择数据库：最多可选择10个数据库。
最大长度：1024 scaffold 否 String 分子骨架表达式。 最小长度：1 最大长度：1024 top_n 否 Integer 最相似的top_n个。 最小值：1 最大值：1000 缺省值：100 databases 否 Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。
路径上的，删除该条待计算路径。 图2 添加或者删除待计算路径 图3 选择配体对 返回相似度后默认全勾选，您可以进行勾选或去除勾选要计算的路径，如果未勾选，则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”，进入FEP设置页面，设置相关参数。
生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
的分子数过少，建议可以适当放宽强约束的条件设置，比如相似度可以放宽到0.3~1.0。如果分子较易优化，优化后的分子相似度较高，新颖性较低，建议可以适当收紧强约束的条件设置，比如相似度可以收紧到0.3~0.7等等，正常情况下相似度设置按照默认即可。 弱约束：优化后的小分子不必要满足
complexity score，合成复杂度分数。 Fsp3： 碳饱和度，旨在评估分子的空间结构复杂度。 结果解释：大于等于0.42为最佳。 NPscore： The Natural Product-likeness score，天然产物的相似度评分。 结果解释：最佳在-5~5之间，分数越高代表越接近天然产物。
smiles String 分子SMILES表达式 source String 分子所属的数据库来源 score Float 分子与查询分子的相似度 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 请求示例 无 响应示例 状态码： 200 分子搜索任务查询成功响应
里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好，与最大化相反，也是只能在弱约束里面进行设置。 相似度分数，是利用ECFP4分子指纹计算生成后分子与原始分子的Tanimoto相似性。我们设置了禁止优化列表，禁止以高毒性为优化目标的属性优化，列表为：hERG Blockers，H-HT，DILI，AMES，Skin
分子对接（molecular docking ）是分子模拟的重要方法之一，其本质是两个或多个分子之间的识别过程，其过程涉及分子之间的空间匹配和能量匹配。分子对接方法在药物设计、材料设计等领域有广泛的应用。 在药物分子产生药效反应的过程中，药物分子与靶酶相互结合，首先就需要两个分子充分
分子SMILES表达式 props Array of objects 分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分
Score：代表小分子可合成性的综合打分。 Vina Score：代表分子如果添加了靶点，将会计算对接结合能。 Similarity：靶点口袋分子设计后的分子与原始分子的相似度。 QED：代表分子的成药性。 图4 查看运行结果（1） 图5 查看运行结果（2） 图6 查看运行结果（3） 图7 查看分子详情 图8 查看作业信息
否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待下载的对象名匹配该参数，则跳过该对象的复制。
包含文件的匹配模式，如：*.jpg。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。首先执行exclude的匹配规则，如果待上传的文件名不匹配exclude，则判断待上传的文件名是否匹配该参数，如
否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待复制的对象名匹配该参数，则跳过该对象的复制。
支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。首先执行exclude的匹配规则，如果待移动的对象名不匹配exclude，则判断待移动的对象名是否匹配该参数，如果匹配则移动该对象，否则跳过该文件的复制。 建议使用引号传递该匹
否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”匹配单个任意字符，例如abc*.txt代表匹配以abc开头以.txt结尾的任意文件。 您可以使用“\*”代表匹配“*”字符本身，使用“\?”代表匹配“?”字符本身。如果待上传的对象名匹配该参数，则跳过该对象的上传。
CPI预测 CPI预测基于蛋白质的一级序列和化合物的2D结构进行靶点匹配，精确的预测化合物-蛋白相互作用。 单击“CPI预测”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件。 支持3种输入方式，分别是输入氨基酸序列、选择文件、输入PDB ID 输入FASTA格式氨基酸序列，输入框最多支持
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