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conda -V 查看当前环境列表，并创建新环境参数。 conda env list conda create -n py37 python=3.7 输入“y”，按“Enter”继续。 切换到新环境。 conda activate py37 生成Notebook kernel。
根据分子对接章节完成参数配置。 分子对接任务完成后，单击“作业中心 > 作业名称”，进入作业在输出结果页面查看。 图1 查看分子对接结果 在输出结果右侧的配体展示列表中，可以单击需要收藏的配体卡片右上方的进行收藏（在3D视图下），收藏配体列表前两位的配体。
流程 EIHealth中的分析流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义。 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。
gatk BaseRecalibrator 基于比对bam文件评估矫正参数。 gatk ApplyBQSR 基于比对bam文件进行矫正。 gatk HaplotypeCaller 基于比对和矫正之后的bam文件进行Variant Calling的工作。
数据上传成功后可以在数据详情页面查询，创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询，复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。
流程管理 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义，流程至少由一个应用组成。 您可以使用该工具创建流程，并进行修改、删除、查询、导入操作。对于由多个应用构成的流程，可通过设置不同应用的输入、输出关系搭建为流程。
图3 靶点配置输入PDB ID 在配置页面输入分子信息，及配置相关参数。 输入方式：支持绘制分子、选择文件、手动输入。 绘制分子：只能绘制一个分子，能够输入分子的SMILES。 选择文件：选择分子文件，最多支持100万个小分子，且分子文件大小不超过2GB。
对于“已取消”、“运行失败”的任务，单击图标，允许修改任务参数，再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现，并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图，可查看详细的3D分子对接结果、结合能排序、药物注释信息。
客户端仅在为请求指定超时（Timeout）参数时会得到该响应。 505 HTTP Version Not Supported 服务器不支持请求的HTTPS协议的版本，无法完成处理。 父主题： 附录
/webapp /opt/webapp #复制图片文件 COPY bd_logo1.png /opt/ #设置环境变量 ENV WEBAPP_PORT=9090 #设置工作目录 WORKDIR /opt/ #设置启动命令 ENTRYPOINT ["ls"] #设置启动参数
gatk-markduplicates:4.1.9.0 docker pull broadinstitute/gatk:4.1.9.0 gatk BaseRecalibrator 基于比对bam文件评估矫正参数。
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