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ows-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。例如，放到C盘Users文件夹中。
第一种，通过获取已经执行成功的NGS配置文件，并在该配置文件基础上进行修改，得到可以用于批量执行NGS的配置文件。本示例介绍使用方法一获取配置文件的方法。 方式一 使用EIHealth平台完成NGS流程的搭建，并执行成功，然后在“分析作业”页面导出作业信息.yaml文件。 方式二
项目角色为项目粒度权限控制，同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题： 项目管理
开启公共读权限 开启公共授权，则数据全网可见，所有用户均可访问。 配置公共读可参考配置标准桶策略，将桶策略设置为“公共读”。一般私密数据不建议用此方法。 目前仅支持访问用户个人OBS下的链接，不支持读取其他用户公共读的链接。 上传待检测的图片 请参见OBS文档上传对象。 获取图片URL 请参见OBS文档获取对象URL。
项目角色为项目粒度权限控制，同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题： 项目管理
云用户协议》及《隐私政策声明》约束。 步骤2：安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 下载Windows版本的客户端，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具
务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上，通过基本原理，构筑起一套模型和算法，从而计算出合理的分子结构与分子行为。SPONGE（Simulation Package
务上均达到性能最优。 SPONGE 分子模拟是指利用计算机以原子水平的分子模型来模拟分子结构与行为，进而模拟分子体系的各种物理、化学性质的方法。它是在实验基础上，通过基本原理，构筑起一套模型和算法，从而计算出合理的分子结构与分子行为。SPONGE（Simulation Package
工作环境 选择系统镜像时，工作环境选择“PY3”。 自定义镜像：当提供的镜像无法满足您的需求时，可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时，需要依赖平台提供的基础镜像，获取地址请参见获取镜像。 CPU 设置CPU大小。 取值范围：1~128，默认为1。
Information 非授权信息，请求成功。 204 No Content 请求完全成功，同时HTTP响应不包含响应体。 在响应OPTIONS方法的HTTP请求时返回此状态码。 205 Reset Content 重置内容，服务器处理成功。 206 Partial Content 服务器成功处理了部分GET请求。
ken。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 method 是 String 聚类方法,当前仅支持hiq_mc。 最小长度：1 最大长度：20 file 是 String 分子聚类源数据。 最小长度：1 最大长度：2000 output_dir
将质控之后得到的Clean Reads比对到参考基因组上。 bwa-mem:0.7.17 该镜像由bwa和samtool合并而成，镜像制作方法请参见制作bwa-mem镜像。 Insert Size Estimation 针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert
n。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 method 是 String 差异计算方法：RMSD、EMD。 枚举值： RMSD EMD file 是 DrugFile object 配体文件。 ref_file 是 DrugFile
to_time 否 Long 查询监控数据截止时间，UNIX时间戳，单位毫秒，不填时默认为当前时间 method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：maximum（最大值）、minimum（最小值）、average（平均值），不填时默认为maximum 缺省值：maximum
配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。 父主题： 运行作业
结”状态。 图1 项目管理 分享项目 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。 已创建一个项目。 操作步骤 单击“操作”列“分享”。 图2 分享项目 输入已添加至平台的用户名称。 图3 输入用户名全称
在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，创建应用。 修改模板时，需填写镜像地址，获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name:
钟粒度）、one_hour（1小时粒度），不填时默认为real_time 缺省值：real_time method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：max（最大值）、min（最小值）、average（平均值），不填时默认为max 缺省值：max metric_name
度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤，涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
real_time five_minutes fifteen_to_twenty_minutes one_hour method 否 String 统计方法。枚举值，取值范围：max（最大值）、min（最小值）、average（平均值），不填时默认为max 枚举值： max min average
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