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data_count Long 数据条目 source_project_name String 源项目名 source_project_id String 源项目id source_id String 源实例id is_prefab Boolean 是否为预置实例 表4 TemplateRsp
更新流程时间 creator String 创建用户名称 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id String 源资源id 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "workflows" : [ {
String 数据作业创建者 source_project_id String 非本项目操作场景下源项目名称 source_project_name String 非本项目操作场景下源项目名称 id String 数据作业ID name String 数据作业名称 sources Array
update_time String 流程的更新时间 source_project_name String 源项目名称 source_resource_id String 源资源id 表4 NextflowParamsDto 参数 参数类型 描述 name String 参数名 最小长度:1
文件来源,支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度:1 最大长度:8 url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1
应用的ID(app-id)或应用的名称、版本、所在项目名称(app-name:version:srcproject)。srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例
ken的值即为Token。 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 source_project_id 是 String 源项目id 最小长度:1 最大长度:128 source_workflow_id 是 String 源流程id 最小长度:1 最大长度:128
流程的ID(workflow-id)或流程的名称、版本、所在项目名称(workflow-name:version:srcproject),srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例
download <srcdir> <destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 srcdir 无 是 源路径。可以为已引用的数据,查看引用数据时,需要使用绝对路径。 destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,下载文件时可选。
作业依赖的组件id,组件当前仅支持流程,取值范围[1,135],支持大小写字母和数字。目前支持两种格式,特殊id:{流程名称}::{流程版本}::{源项目名称};正常id:流程id tool_type #
health upload <srcdir> <destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 srcdir 无 是 源路径。 destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,上传文件时可选。 --recursive -r 否 递归上传
流程命令示例。 流程的名称、版本、所在项目名称(workflow-name:version:srcproject),srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。例如ngs:1.0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。
描述 method 是 String 聚类方法,当前仅支持hiq_mc。 最小长度:1 最大长度:20 file 是 String 分子聚类源数据。 最小长度:1 最大长度:2000 output_dir 是 String 分子聚类输出结果。 最小长度:1 最大长度:1200 响应参数
子搜索、FEP、聚类详情页。 大分子涉及靶点口袋发现、靶点优化。 使用限制 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 如果收藏分子的源作业被删除,收藏列表依旧可以正常展示。 收藏夹收藏最多500条。 收藏分子 分子对接、分子优化、靶点口袋分子设计、分子生成、靶点口袋发现、靶
数据库实例id,其中引用数据库实例时可以引用多个数据库实例,用分号(;)分隔;导入数据到数据库时不支持多个实例id。 --project -p 否 源项目名称,使用此参数时代表引用数据库实例。 --skip-lines -s 否 跳过的header行数,导入数据到数据库时此参数必填。 --delimiter
download <srcdir> <destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 srcdir 无 是 源路径。 destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名。 --recursive -r 否 按指定的对象名前缀批量下载,批量下载时必选。
health upload <srcdir> <destdir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 srcdir 无 是 源路径。 destdir 无 是 目的路径。 --rename -e 否 重命名,上传文件时可选。 --recursive -r 否 递归上传
指定workflow-id或workflow-name:version:srcproject,列出具体应用的信息,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板,模板为yaml格式。 --downloadPath
基于流程ID创建分析作业,可使用health get workflow workflow-name:version:srcproject命令查询流程ID,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。 --description
作业依赖的组件id,组件当前仅支持流程,取值范围[1,135],支持大小写字母和数字。目前支持两种格式,特殊id:{流程名称}::{流程版本}::{源项目名称};正常id:流程id 最小长度:1 最大长度:135 tool_type 是 String 作业依赖的组件类型,仅支持填写workflow