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了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒的快速检测,并在线分析各种病毒的相对载量。 抗病毒药物研发 计算机辅助药物筛选根据病毒靶点和小分子药物的3D结构,计算病毒蛋白与药物之间的结合能量,实现从成千上万的小分子库中筛选出与病毒结合最紧密的候选药物,从而快速为药物研究和临床试验提供方向。
和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 启动作业时,如果包含不存在的计算节点标签,回显类似下图,请先添加计算节点标签。 计算节点标签添加方法:在平台右上角单击用户名,选择“系统资源 > 计算资源”,在计算节点的操作列单击“更多 > 标签管理”,添加标签。上图示例中需要添加的标签名称为labelsss1。
进行运行。 计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。
别代表计算资源、性能加速资源、数据库资源和存储资源。 --action -a 否 查询计算节点方式。 取值范围: get-labels:获取计算资源标签列表。get-labels要和--node一起组合使用。 list:获取计算资源列表。 flavors:获取可用区下的计算节点规格列表。
配额管理 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
医疗智能体(EIHealth)平台是基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。 平台为您提供高性能、高可靠性、高性价比的计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行,提升医疗健康的服务能力和普惠水平。同时通过丰富的加速技术,实现算法工具的数倍加速,加速生物医疗大数据的分析。
提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。 支持十亿节点、百亿边的超大规模图数据库查询,提供适用于基因和生物网络数据的图深度学习算法。 拥有基于基因组数据自动
基因平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择,计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用为按需计费,计费详情请参考OBS流量费用中“公网流出流量
图1 资源看板 购买计算资源 在“计算资源”页面,单击“购买计算资源”。 选择“可用区”、“计算规格”、“系统盘”、“数据盘”、“计费模式”、“购买时长”、“购买数量”。 图2 购买计算资源 可用区:选择可用区。 计算规格:分为通用计算增强型、内存优化型、BMS计算型、磁盘增强型、超
药物虚拟筛选 计算机辅助药物虚拟筛选是新药早期研发的重要环节,可根据靶点蛋白和小分子药物的3D结构,计算蛋白与药物之间的结合能量,并且依托云端大算力实现超大规模筛选和成药性分析,从成千上百万的小分子库中快速筛选出与蛋白结合最紧密的候选药物,从而为药物研究和临床试验提供方向。药物虚
配额说明 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。 如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》
单击“确认”,转移项目。 设置项目存储容量 平台支持项目管理员以上角色,配置项目的最大存储量。 单击项目名称,在项目页面选择“设置”。 在项目详情页面,单击“已用存储量”后面的。 图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。 项
ADMET属性预测接口 功能介绍 计算小分子的物化性质,包括吸收(adsorption)、分布(distribution)、代谢(metabolism)、清除(excretion)与毒性(toxicity)。 URI POST /v1/{project_id}/admet 表1 路径参数
object 规格信息 availability_zone_id String 可用区 space Integer 最大容量, 单位GB free_space Double 可用容量,单位GB charge_mode String 计费模式 period_num Integer 购买周期 running_job_count
参考配体后系统自动计算,用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”,选择配体对。 页面显示:正在规划自动路径,您也可以直接选择配体对后进行下一步。 待计算路径:选择待计算的路径。待计算路径起点是中心配体
受体预处理(Fasta格式) 功能介绍 受体预处理(Fasta格式),用于前端计算预期扣费次数 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess
ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 功能介绍 计算小分子的物化性质,包括默认的吸收(adsorption)、分布(distribution)、代谢(metabolism)、清除(excretion)与毒性(toxicity),以及用户自定义的属性。 URI POST /v
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