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步骤2:获取Notebook基础镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr.${region}.myhuaweicloud
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题: API(盘古辅助制药平台)
骨架的分子。 选择数据库:最多可选择10个数据库。 选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 输出个数:输出个数越多,任务时间越长。 作业名称:设置作业名称。长度为5~64个字符,仅可以使用字母、数字、下划
csv,修改描述为simple database。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database/{database_id} { "description" : "simple database", "file" :
"24dfce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289", "database_name" : "demo-database", "database_id" : "4f7fce53-0303-4b46-a2d9-4a067812b289",
数据库资源管理 获取数据库资源规格列表 删除数据库资源 购买数据库资源 查询数据库资源 父主题: 系统管理
创建study作业 功能介绍 创建study作业 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-pro
template_id String 生成study作业结果的模板id database_name String study作业结果的数据库实例名称 database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径
/v1/{project_id}/drug/databases/{database_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 database_id 是 String 数据库id 最小长度:1
、比对、变异检测等步骤,最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤,涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
URI POST /v1/{project_id}/system/database-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2
/v1/{project_id}/drug/databases 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 search_key 否 String
删除项目中的数据,创建、获取、删除、恢复归档数据,也可以对数据作业执行获取、删除、重试、取消操作。 数据库管理 您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板,创建、获取和删除数据库实例,也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法,将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择
"source_database_id": "e06f784f-c561-4323-92cd-....", "destination_database_id": "0589ab48-d685-483f-92b7-....", "destination_database_name":
SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白:受体蛋白文件,支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称:数据库的名称。 输出文件格式:可以将流程生成的分子对接结果,保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据库和药物配体注释信息数据库,并提供对应的数据库模板。您可以在“数据库”页签单击“shennongProject-database”和“ligandAnnotation-database”数据库查看数据库详情,在“模板”页签单击“shennongProject”
系统通知 在系统通知页签,可以查看系统通知的内容、时间。单击某个消息,可查看消息的详细内容。可以在该页面面查看全部、未读和已读的消息。平台首页也会有未读消息提示。 图1 平台首页查看消息通知 图2 查看系统通知 支持标记为已读和批量标记为已读 如果需批量标记已读,可以勾选多个未读的消息,单击“标记已读”。
请求要求代理的身份认证,与401类似,但请求者应当使用代理进行授权。 408 Request Timeout 服务器等候请求时发生超时。 客户端可以随时再次提交该请求而无需进行任何更改。 409 Conflict 服务器在完成请求时发生冲突。 返回该状态码,表明客户端尝试创建的资源已经
应用间的输入输出关系,完成应用的连接。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建流程,创建好的流程将同步显示到EIHealth平台。 获取流程模板 使用health get workflow -s命令获取创建流程的模板,复制模板并保存到本地,您可以保存成.yaml或txt文件,保存