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主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
修订记录 发布日期 修订记录 2022-08-10 第十次正式发布 新增基于STAR-CCM+部署HPC集群 2021-08-11 第九次正式发布。 新增 1.1-图解HPC解决方案 2019-02-15 第八次正式发布。 新增 配额调整 2018-09-30 第七次正式发布。 修改
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
常见问题 为什么集群被删除后还在计费? 在部署/创建集群过程中出现某个节点未加入集群或者不存在需要怎么办? 集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 集群创建任务提交失败,提示“Insufficient EIP quota”怎么办? 集群创建提交失败,提示集群配额不足怎么办?
ic Cloud Server,ECS),容器(CCE&CCI),裸金属服务器(BMS)提供共享访问,能够弹性伸缩至320TB规模,具备高可用性和持久性,为海量的小文件、低延迟高IOPS型应用提供有力支持。 使用背景 STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例
图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面,查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求,请参考后续操作,申请扩大配额。 如何申请扩大配额? 登录管理控制台。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图2 我的配额 单击“申请扩大配额”。
效率低下导致决策缓慢,失去市场、以及开发研究成果的良机。 应用计算量快速膨胀,对性能要求越来越高。 公有云上应用HPC场景,能充分利用云服务的优势。使用公有云进行高性能计算具有以下优势: 降低TCO 可以按需租用,成本低,降低中小客户使用HPC的门槛。 提高效率 按需发放,快速部署与扩容,加速产品上市时间和缩短科研周期。
的大量计算时间,提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需租用,成本低,降低中小客户使用HPC的门槛。 提高效率 按需发放,快速部署与扩容,加速产品上市时间和缩短科研周期。 使用灵活 在镜像模板中预制MPI库、编译库及优化配置,加快环境部署。 企业分支、科研组织机构
程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。 基于消息的事务:数据被作为离散消息处理,而不是作为流,这消除了应用将流分成不同消息/事务的需要。 分散/收集条目支持: RDMA支持本地处理多个分散/收集条目,即读取多个内存缓冲
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
MMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
磁盘包括系统盘和数据盘。您可以为裸金属服务器添加多块数据盘,系统盘大小可以根据需要自定义。 Windows裸金属服务器暂不支持挂载磁盘。 系统盘 如果选择支持快速发放的规格,界面会提供系统盘配置项,可以根据需要设置磁盘类型和大小。 数据盘 您可以为裸金属服务器添加多块数据盘,并设置数据盘的共享功能。
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root