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您可以单击右上角“New”，然后选择AI引擎“Python 3”，创建一个用于编码的文件。 Jupyter Notebook页面不支持创建名称中带有特殊字符< > ' " ; \ ` = # $ %% ^ & ( )的文件或文件夹。 图2 选择AI引擎“Python 3” 编写文件 新建文件后，
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时，需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如，设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时，首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照Fa
数据的上传和下载 在Notebook页面，可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter
csv文件及图片等功能。 可以说，JupyterLab是开发者们下一阶段更主流的开发环境。JupyterLab支持更加灵活和更加强大的项目操作方式，但具有和Jupyter Notebooks一样的组件。 打开JupyterLab 选择状态为“运行中”的Notebook实例，单击“
修改应用 使用edit或update命令修改应用的内容，应用的名称和版本不支持修改。 命令结构 health edit app ID [flags] # edit和update作用相同 health update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”，获取输出结果的路径。 文件的命名方式为：蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
e、Centos等。 基础编程语言类镜像，如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像，如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像
Notebook安装Conda指导 打开Notebook，在“File”页签下选择“Terminal”。 图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda.com/archive/index
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置，默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
memory和gpu） # 其余参数无须改动 'app': { 'image': 'project_name/genomeagent:1.0.0', # 根据情况修改resources下的参数（例如cpu、memory和gpu）
使用import命令从源项目导入镜像到当前项目。 只支持导入私有镜像，导入镜像和订阅的镜像不支持再次导入到别的项目。 命令结构 health docker import <project-name/image-name:tag-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选
项目成员和权限 医疗智能体以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 添加项目成员 移除、修改项目成员 成员角色和权限 添加项目成员 前提条件 平台管理员首先通过“用户管理”功能添加平台用户，才能将该用户添加至项目中。 创建用户的详细方法请参见创建平台用户。
单击项目名称后面，进入项目设置页。 选择“成员管理”，在“权限”列重新设置项目成员角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图3 移除、修改项目成员 选中成员，单击操作列“移除”，将成员从项目中移除。 成员角色和权限 在项目中，成员可以划分为5种不同的角色。详细角色介绍请参考表 项目成员角色。
修改供应商logo和名称配置 使用update或edit命令修改供应商logo和名称配置。 命令结构 health edit vendor-config [flags] 或者 health update vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc
、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB image: 'gwj-test-01/busybox:latest' # docker镜像地址，取值范围[5-255]，不能包含中文字符 commands:
母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 - labelA - labelB image: 'gwj-test-01/busybox:latest' # docker镜像地址取值范围[1-255]，不能包含中文字符，格式为{proje
OK { "logo" : "base64-type image string", "name" : "vendor-example" } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题： 系统配置和供应商配置
5]，单个标签最大长度32字符，支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线，且不能以空格开头或者结尾。 最小长度：1 最大长度：32 数组长度：0 - 5 image 是 String docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands
类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任
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