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在使用命令行工具前，需要初始化配置信息，通过config命令对eihealth-toolkit进行初始化配置。本节以Windows为例介绍配置过程，Linux和macOS环境配置过程相同。 方法1：使用账号、密码初始化 执行以下命令，进行初始化，命中的xxx和region信息请参考表2进行替换。
要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境，或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台
project-name 无 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 执行以下命令，删除项目demo-project。 health delete project
--description test # 返回结果如下 create archive h-test2 successfully! Linux和macOS使用时，多个路径使用;进行分隔，整个路径使用''引起。例如： ./health create archive lmx-test-cli --path 'newjob/;output/'
列举路径中的文件夹对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时，需要使用路径/文件名或路径\文件名格式，如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个路径用""括起来，或者用\将字符转义，例如：health cp "/src2/abs（1）
命令，即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录，请使用cd命令切换路径。例如，切换至D盘： cd /d d: 使用Linux版本命令行工具时，您需要在本地搭建Linux环境，并将下载的health文件放至所需的目录下。 如果当前目录为health所在目录，可以使用
mkdir input-data命令创建名为input-data的文件夹。 将本地数据上传至项目文件夹中。 例如，将Linux系统下root/health_test路径中xxx.R1.fastq.gz数据上传至ngs-project项目的input-data文件夹中。 ./health
txt ^> ${dir-out}/adme.log 2^>^&1"""";"cat ${dir-out}/adme.log" # Linux系统下镜像启动命令 'bash -c "source activate my-rdkit-env && python adme.py --file_in
zip.sha256 Linux ARM 64位 health-linux-aarch64.tar、health-linux-aarch64.tar.sha256 Linux AMD 64位 health-linux-x86_64.tar、health-linux-x86_64.tar
建议使用引号传递该匹配模式（macOS/Linux操作系统使用单引号，Windows操作系统使用双引号）防止特殊符号被操作系统转义，导致不可预期的结果。该匹配模式作用于对象全路径（含从根路径开始的对象前缀和对象名，例如，桶内对象路径为obs://bucket/src1/src2/test
-r 列举路径中的对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时，需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用，如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个路径用""括起
和文件夹至本地data路径中。 health download /src/ D:\local\data --update -r 列举路径中的对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个路径用""括起来，或者用\将字符转义，例如：health
com/archive/Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64.sh 安装Anaconda。 执行如下命令。 wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.10-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate
在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行（该特性规划中，暂未上线）。
云服务器创建成功后，在云服务器列表页，选中待登录的弹性云服务器。单击“远程登录”，输入ECS初始账号，登录ECS。 图1 云服务器列表 安装容器引擎。 例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker
内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。 参数确认无误后
说明 --path -p 附加参数，可选。 修改权限的目录或文件绝对路径。 --delete-policy -d 附加参数，可选。 设置目录或文件是否允许删除。取值包括：allow、deny。 命令示例 设置路径不可删除。 chattri -p /path/1/ -d deny
据不能在该项目中进行更改。只能用来运行作业，导入数据到数据库等操作。 图3 引用数据 URL导入数据 以URL导入的方式添加数据类似于linux中的wget操作。单击“添加URL”按钮可以添加具体的链接，最多可添加10条链接。 图4 URL导入数据
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