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受体信息解析 功能介绍 受体信息解析，如果有多个受体蛋白则只处理第一个，如果一个受体蛋白里结合了多个配体，则最多只处理前10个。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
数定义。分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 在EIHealth平台，创建流程通过拖拽应用的方式完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出，对于由多个应用搭建出来的流程，命
Notebook在“TensorFlow-1.8”的环境中安装Shapely。 打开一个Notebook实例。 在Jupyter控制面板中，选择“New”（新建），然后选择“TensorFlow-1.8”。 在新建的Notobook中，在代码输入栏输入如下命令。 !pip install Shapely 在Terminal中安装
单击“分子对接”功能卡片，进入分子对接受体预处理页面，单击上传受体文件，进行受体蛋白预处理配置。 受体文件仅支持PDB格式，若文件中存在多个受体，默认只处理第一个。受体文件支持上传1个或者多个文件，最多支持输入20个受体文件，文件来源包含数据中心、PDB库、示例数据。 图1 上传受体文件 受体预处理参数配置。
配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
r99sb。 水模型：水模型支持spc, spce, tip3p, tip4p, tip5p类型，默认是tip3p。 离子种类：支持NaCl、MgCl2、None几种类型。若平衡电荷设置为True，则不支持离子种类选择None。 离子浓度：离子浓度支持范围是0<离子浓度≤5mol/L，默认是0
导出作业 使用export命令导出作业信息。 导出的作业信息会以zip文件格式保存到当前目录，zip文件中包含以下两个文件： jobDetails.zip：保存job的yaml文件 jobInfo.csv：保存job信息 命令结构 # 使用job-id导出作业 health export
新建流程 流程说明 分析流程至少由一个应用组成，在多个应用构成的流程中，一个应用的输出作为另一个应用的输入，流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流。 EIHealth中的流程由应用搭建形成，应用包含了数据的输入、输出等参数定义。 应用呈现的信息在创建应用过程中定义，包含参数名称、数据类型、描述、默认值等。
口袋或作为片段优化，存在多个原始配体时可通过下拉框选择，与上传配体文件二选一。 上传配体文件：通过上传与靶点结构有良好结合构象的配体文件确定配体，若文件中包含多个配体，默认只处理第一个，与选择原始配体二选一。仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。 分子量：自适
过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 获取区域名称 区域是一个地理区域的概念，由于带宽原因，会在多个地区建立数据中心，提供服务。 医疗智能体服务部署在华北-北京四，区域名称为cn-north-4；部署在华东-上海一，区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具
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project-name 无 否 项目名称，不填时默认为当前所在项目。 --description -d 否 项目描述。 只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签，多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设
说明 archive-name 无 是 归档名称。 --path -p 是 归档的数据路径，多个对象用分号(;)分隔，开头不需要加/。例如， "xxx";"yyy"。 --description -d 否 归档描述。 --delete -l 否 是否删除已归档数据（默认false）。
可用区（AZ，Availability Zone） 一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合，有独立的风火水电，AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连，以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。 项目 华为云的区域默认对应一个项目，这个项目由系统预置
# 列是否作为主键，必填，若有多个列设为true，则多个列组成复合主键 searchable: true # 列是否可查询，必填 tips: uuid #
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像，并将镜像上传至EIHealth平台，通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用，也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”
同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时，如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果，可以新建该文件的多个视图。 打开此文件，然后单击菜单栏“File>New View for Notebook”，即可打开多个视图。 图9 同一个文件的多个视图 父主题：
id。 --description -d 是 描述。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 health update notebook xxxx --description update
器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过划分角色实现项目权限的划分。
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