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是否必选 说明 template-name 无 否 模板名称，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板名称。 --description -d 否 描述，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板描述。 --yaml -y 是 本地模板yaml文件。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
删除数据库模板 使用delete命令删除数据库模板。 命令结构 health delete database template <template-id> [flags] 或者 health delete db template <template-id> [flags] 表1 参数说明
获取自动作业模板列表 功能介绍 获取自动作业模板列表 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id:
yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时，详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow:
不带--detail参数，以yaml格式展示作业基本信息。 带--detail参数，以json格式展示作业基本信息。 --detail -d 否 配合ID使用，返回作业的详细信息。 --sample -s 否 获取作业模板，模板为yaml格式。 --limit -l 否 代表当次请求获取的最大查询条数（默认为10）。
息，srcproject为源项目名称，可选。不指定srcproject时，默认为当前项目。 --sample -s 否 获取流程模板，模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取workflow详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project
指定srcproject时，默认为当前项目。例如GATK:4.0:projectname。 --sample -s 否 获取应用模板，模板为yaml格式。 --downloadPath -d 否 获取应用详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project
获取到的模板使用命令行工具启动分析作业，运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。 获取作业模板 使用health get job -s命令获取启动分析作业的模板，复制并保存模板至本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本
数据库创建好以后，您可以参照数据库模板格式，将已有的数据进行导入。 单击数据库右上角“导入数据”。 图3 选择导入数据 选择需要导入的数据文件。 请选择*.csv , *.txt, *.vcf格式文件，当前仅支持utf-8编码。 导入数据列与模板保持一致，无需考虑自动作业新建的作业状态更新列。
件创建为数据库。 创建数据库时，数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架，可通过数据库模板灵活的定义数据结构，描述数据及其关系。数据库以项目为粒度进行资源的隔离和访问控制，不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 预置数据库和模板 平台内置“神农项目”药物虚拟筛选数据
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
受体预处理（Fasta格式） 功能介绍 受体预处理（Fasta格式），用于前端计算预期扣费次数 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess
health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
用户名：邮箱的用户名，如果未修改过，默认为邮箱地址。 密码：邮箱开通SMTP功能时生成的一段随机字符。 消息头：发送邮件时，邮件标题。 语言：选择中文或英文。 删除邮箱后，将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后，单击“测试”，验证配置是否有误。配置成功后将在邮箱中收到测试通知。 图2 邮箱测试通知
health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d 否 应用的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
基于获取到的模板使用命令行工具创建应用，创建好的应用将同步显示到EIHealth平台。 获取应用模板 使用health get app -s命令获取创建应用的模板，复制模板并保存到本地，您可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。 在本地编写
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题： 系统管理
SDF、PDBQT格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板：使用资产市场订阅的流程时，模板已预置，无需选择数据库模板。 数据库名称：数据库的名称。
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