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HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
弹性云服务器”。 进入弹性云服务器信息页面。 单击“创建弹性云服务器”,开始创建应用集群。 按照界面提示,填写弹性云服务器的参数配置,详细操作请参见创建支持IB网卡的弹性云服务器。其中, 规格:需与转化的私有镜像的云服务器规格保持一致。 镜像:选择“私有镜像”,然后选择制作私有镜像中制作的私有镜像。
HPC解决方案服务当前只支持“华北-北京一”、“华北-北京四”、“华南-广州”区域,推荐使用“华北-北京四”,其他区域暂不支持。 集群部署仅支持slurm和sge两种调度器。 集群部署支持鲲鹏架构的sge调度器,支持X86架构的slurm和sge调度器。 单个用户可创建集群的上限为3个。 单个集群中的计算节点的上限为2000个。
MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE,请联系技术支持进行操作,建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。 目前仅c6h.22xlarge.2.physical、c6h.22xlarge.4.physical规格支持RoCE,其它规格暂不支持。 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
IPoIB的约束和限制 支持管理一个IB网卡。 继承BMS、H2型、HL1型、HI3型云服务器对IB网卡的使用约束与限制,使用IPoIB特性的弹性云服务器不支持迁移。 继承H2型、HL1型、HI3型云服务器对IB网卡的使用约束与限制,使用的IB网络不支持安全组、Qos、三层及以上网络功能。
),裸金属服务器(BMS)提供共享访问,能够弹性伸缩至320TB规模,具备高可用性和持久性,为海量的小文件、低延迟高IOPS型应用提供有力支持。 使用背景 STAR-CCM+运行需要提供一个集群中所有节点均可读取的算例输入文件,通常做法是将算例文件放到NAS存储中,华为云SFS
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以4.0.2版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4
安装和使用社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户在BMS上安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
a"导致启动失败 问题现象: STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败,OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用,报错如下图所示。 解决方案: 1.请参照STAR-CCM+安装与运行章节的命令,在OpenMPI场景
务。通过弹性文件服务SFS为集群提供共享存储的功能。 当集群为运行状态时,您可以选择挂载/卸载弹性文件服务。当集群在创建中或部署状态时,不支持挂载/卸载共享文件服务。 挂载共享存储 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“共享存储”进入共享存储管理页面。 在“共享存储”页,在左上角选择集群。
配置ECS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在ECS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。仅支持在使用密钥登录弹性云服务器的情况下配置ECS集群互相免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo
自定义。 Windows裸金属服务器暂不支持挂载磁盘。 系统盘 如果选择支持快速发放的规格,界面会提供系统盘配置项,可以根据需要设置磁盘类型和大小。 数据盘 您可以为裸金属服务器添加多块数据盘,并设置数据盘的共享功能。 裸金属服务器仅支持SCSI磁盘模式。 共享盘:勾选后,数据盘
提供预装操作系统、应用环境和各类软件的优质第三方镜像。 选择“登录方式”。 登录方式会和集群初始创建时保持一致,若集群创建时选择了密码方式,扩容就只支持密码方式,若集群创建时选择了密钥方式,扩容则只支持密钥方式。 密钥对 指使用密钥对作为弹性云服务器的鉴权方式。您可以选择使用已有的密钥,或者单击“查看密钥对”创建新的密钥。
单击下拉框查看支持的云服务器规格。 系统盘:根据所需要的选择磁盘类型和大小。 选择云服务器类型前,请认真阅读各种类型云服务器的介绍和注意事项。具体内容请参见实例类型。 选择“计算节点配置”。 规格:公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择,单击下拉框查看支持的云服务器规格。
所选的计算节点数不超过50个。 选择“虚拟私有云” 虚拟私有云为选定的管理节点所在的VPC,无需选择。 设置“登录方式”。 已有节点部署集群,当前只支持密码方式,如果您使用“密钥”方式创建的云服务器,请手动设置登录密码,另外,使用密码方式时请增强密码的复杂度,保证密码符合要求,防止恶意攻击。
HPC断点续算计算方案 2018-07-30 第五次正式发布。 增加 Platform MPI和在HPC集群上运行Platform MPI,弹性云服务器支持使用Platform MPI。 修改 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI 在H
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用