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# 命令结构 health docker push <image-name:tag-name> [flags] # 命令示例 health docker push project-demo-image:v1.0 执行health docker images命令查看已有的镜像。
/a download workflow detail successfully!
health docker rmi demo-image:v1.1 或 health docker rmi lmx-project-01/demo-image:v1.1 # 执行成功返回结果如下 untagged:lmx-project-01/demo-image:v1.1 父主题
请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。
实际上作业的子任务对应的就是K8S中的一个Pod,其返回状态就是Pod的phase映射,即容器以非0状态退出或者被系统终止会算作失败;容器return 0并且不再重启即算成功。详细内容介绍请参见Pod的生命周期。
", "name" : "eihealth.bms.spec.bms2.12xlarge.dgx2", "ram" : 8192, "vcpus" : 4, "max_rate" : 8000, "min_rate" : 2400,
简介 Nextflow是专门针对生物信息流程搭建而开发的一种框架语言,它能够很好的管理生信流程,并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用,可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移,并且能够保证结果的可重复性。
最小长度:1 最大长度:32768 X-Bucket-Name 否 String X-Bucket-Name 最小长度:1 最大长度:128 X-Namespace-Name 否 String X-Namespace 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 状态码: 200 表3
String pod名称 submit String 提交时间 complete String 完成时间 duration Long 总时间 realtime Long 实际运行时间 cpu_percent Double cpu使用率 mem_percent Double 内存使用率
镜像管理 镜像管理简介 导入或上传镜像 安装容器引擎 获取镜像 制作Docker镜像 上传镜像到SWR镜像仓库 发布镜像 父主题: 用户指南(基因平台)
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
镜像 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。
BMS Rule: 频繁命中化合物过滤,BMS数据库具有176个子结构。 结果解释:同PAINS。 Chelator Rule: 频繁命中化合物过滤,Chelator数据库具有55个子结构。 结果解释:同PAINS。
AccessKeyId=VQ52M3Q7I4WPWPDUB5XZ&Expires=1678190993&Signature=oRiADod2TExnsP56Q9k%2FSgm4h9g%3D" } 获取作业详情 # 获取作业详情 health nextflow get job "a37c22fc
镜像管理 发布镜像 导入镜像 订阅镜像 更新镜像描述信息或者类型 删除镜像仓库 批量删除镜像tag 删除指定镜像tag 获取镜像列表 创建镜像 获取docker login指令 获取指定镜像的tag列表 父主题: 项目管理
计算资源管理 购买计算资源 查询计算资源 删除计算资源 获取节点剩余配额 查询计算资源规格 关闭计算资源 重启计算资源 启动计算资源 修改计算资源调度信息 查询计算资源调度信息 查询bms计算资源显卡id列表 获取EVS配额及使用情况 父主题: 系统管理
作业管理 获取作业列表 启动作业 获取作业详情 删除作业 更新作业 获取作业事件 获取作业日志 获取子任务启动事件 获取子任务实例信息 获取子任务中实例的事件 获取子任务中实例的pod信息 获取子任务中实例的资源监控数据 重试作业 取消或强制停止作业调度 批量取消作业 批量重试作业
相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。
结果清单文件命名规则:cp_{succeed | failed | warning}_report_时间_TaskId.txt。
TaskInstanceMetadataRsp object 实例元数据信息 spec TaskInstanceSpecRsp object 实例cpu和内存使用率信息 表6 TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip