检测到您已登录华为云国际站账号,为了您更好的体验,建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
标记镜像 使用health docker tag命令给待上传的镜像打标签。 执行镜像相关命令,请在本地搭建Docker环境,要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 默认标记到当前所在项目,需先使用切换项目命令进入想要上传镜像的项目。
获取节点标签集 功能介绍 获取节点标签集 URI GET /v1/{project_id}/system/cluster/labels 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。
source" : "public", "url" : "project:/test/url.csv", "eihealth_project_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "status" : "SUCCESS
表3 执行状态说明 执行状态 说明 SUCCEED 执行成功。 FAILED 执行失败。 PROCESSING 数据删除、导入等操作正在处理中。 START 项目删除操作开始执行。 RUNNING 分析作业运行中。 PENDING 分析作业等待处理中。
URI DELETE /v1/{project_id}/drug/css-clusters/{css_cluster_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
94116a6b-1945-4581-b64c-2cea712988ab", "name" : "DataDelete-20210421093037", "create_time" : "2021-04-21T09:30:37Z", "status" : "SUCCEED
将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 容器镜像服务支持使用容器引擎1.11.2及以上版本上传镜像。 父主题: 镜像管理
demo-job", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "priority" : 0, "timeout" : 1440, "status" : "SUCCEEDED
最小长度:1 最大长度:128 success Boolean 解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 formula String 配体分子的化学式。
destination_database_id" : "25e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488", "destination_database_name" : "database_name", "failed_reason" : null, "status" : "success
"X86", "memory" : "1G", "gpu_type" : "GPU", "gpu" : "0" }, "io_acc_type" : "SFS" } ] } 响应示例 无 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED
destination_template_id" : "86e0f1b0-ac10-46a5-8fa7-b26831d7d488", "destination_template_name" : "imported-template", "failed_reason" : null, "status" : "success
URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/{job_id}/cluster 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID
2.0.0 health docker push gatk-markduplicates:4.1.9.0 health docker push gatk-bqsr:4.1.9.0 health docker push gatk-applybqsr:4.1.9.0 health docker
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 配置完成后,运行docker命令,可查看docker的信息。 图1 docker信息 构建fastqc镜像。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令,如果显示如下类似信息,表示Docker安装成功。
execution log 提示K8S pod can‘t be scheduled,请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock file,重试或者克隆作业即可。
curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令,如果显示如下类似信息,表示Docker安装成功。