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output_dir: # 流程的当前工作目录，默认为根目录，用户可显示指定，必须以/开头，结尾不能有/。 tasks: #
finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。
最大值：5000 缺省值：0 alerts 否 String 高亮子结构编号。 最小长度：0 最大长度：5000 ncols 否 Integer 显示的列数。 最小值：0 最大值：100000 缺省值：0 bgopacity 否 Float 背景透明度。 最小值：0 最大值：1 缺省值：0
com -o get-docker.sh sh get-docker.sh 检查安装结果。 执行docker --version命令，如果显示如下类似信息，表示Docker安装成功。 图1 Docker安装成功 步骤2：制作镜像 方法1：直接下载官方的FastQC镜像。 执行如下命令下载FastQC镜像。
单击“镜像”，在镜像列表中查看已上传的镜像。 图1 镜像列表 【可选】单击“镜像类型”，对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型，新上传的镜像默认显示为“OTHER”，您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP：用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK：用于创建Notebook的镜像。
update_time String 数据库更新时间。 creator String 创建数据库的用户名称。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 css_id String css集群id。 css_name String css集群名称。 files Array
步骤3：启动作业 在流程页面，单击“启动作业”按钮，根据实际情况填写作业名称等信息。 图5 启动作业 图6 设置作业名称 作业设置完成后，会显示流程中的各个应用信息，再此可以指定实际的运行参数。 图7 NGS流程 单击图标，可设置数据来源，可以指定File或者Directory类型
流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow 550e8400-e29b-41d4-a716-446655440000
gatk-mergevcfs、discvrseq-variantqc连线关系 搭建好的流程如下图所示。单击流程设计器上方保存按钮，保存流程。创建好的NGS将显示在“项目管理 > 工具”页签中。 图8 NGS流程 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测
create_time String 作业创建时间 finish_time String 作业结束时间 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回 failed_reason String 失败原因，当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称
finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。
分析流程通过流程设计器创建，创建好的流程将存储于项目中。同时，您也可以通过“导入流程”的方法，将隶属于其他项目的流程导入至自己的项目中。 创建好的流程显示在流程列表中，您可以基于这些流程创建分析作业。 详细的流程创建和运行请参见新建流程。 父主题： 用户指南（基因平台）
是否作为主键 searchable Boolean 是否可查询 unique Boolean 是否唯一 tips String 查询参数格式的提示信息 最小长度：0 最大长度：1024 请求示例 无 响应示例 状态码： 200 OK { "name" : "demo-instance"
finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。
创建、导入、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选 创建、修改、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 项目列表中只显示您所在的项目。 一个用户可以是多个项目的成员。 父主题： 项目管理
object 区间上下限，仅回归型存在。 description String 模型描述信息。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 losses Array of floats 模型训练loss信息。 metrics Array of ModelMetric
finish_time String 作业结束时间。 start_time String 作业开始时间。 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回。 user_name String 创建任务的用户名称。 output_dir String 作业结果输出目录。
偏移量，查询起始偏移，必须由数字组成，默认为0，取值范围[0,100000000]，获取数据作业列表时生效。 --log -g 否 在界面显示数据作业执行日志，需要与data-job-id一起使用。 说明： 参数--log和--file不能同时使用。 参数--log的优先级高于-
create_time String 作业创建时间 finish_time String 作业结束时间 failed_message String 失败提示，当作业执行失败时会返回 failed_reason String 失败原因，当作业执行失败时会返回 user_name String 创建任务的用户名称
${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数 单击“立即创建”，完成fastqc应用的创建。 创建完成后的应用，将显示在应用列表中，您可以使用该应用创建分析作业。 图5 查看应用 步骤4：搭建流程、运行作业 进入“工具 > 流程”页面，点击“新建流程”进行
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