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计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
账号”页签,则说明是主账号。 图1 查看账号信息 购买服务 医疗智能体平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍,请参见计费说明。 登录华为云管理控制台,在左侧服务列表中选择“人工智能 > 医疗智能体 EIHealth”。 图2 服务列表
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我的凭证”。 在API凭证中可以查看相关信息。 购买服务 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍,请参见计费说明。 登录华为云管理控制台,在左侧服务列表中选择“人工智能 > 医疗智能体 EIHealth”。 图2 服务列表
不用自己去写复杂的并行化的程序,只需要关注“数据流”即可。流程中的每个process可以通过配置文件快速的定制并行执行的样本数目,大大节约了生信人员搭建组学分析流程的时间。 医疗智能体(EIHealth)平台集成了Nextflow框架,支持用户直接在医疗智能体(EIHealth)平台安装Nextflow。
space Integer 最大容量, 单位GB free_space Double 可用容量,单位GB charge_mode String 计费模式 period_num Integer 购买周期 running_job_count Integer 作业运行数 job_quota Integer
计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业
genomeagent默认从环境变量中获取'USER_APIKEY/USER_HEADERS'变量内容作为访问。 # 如果所用的大语言模型使用OpenAI模式部署的模型推理服务 # 模型参数attributes和网络访问proxy均应该遵循你的模型服务设置 # 例如: '
定义。分析流程由至少一个应用组成,流程中的各个应用由其前后顺序关系形成数据流,前序应用为后序应用提供输入。医疗智能体基因组分析平台为您提供了多种分析流程,帮助您快速完成分析任务。 Notebook Notebook是一个交互式应用程序,提供开发调试、代码运行、文档编写和结果展示等
} } 到这里为止这个请求需要的内容就齐全了,您可以使用curl、Postman或直接编写代码等方式发送请求调用API。对于获取用户Token接口,返回的响应消息头中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后,您就可以使用Token认证调用其他API。
应用场景 AI医疗影像 AI药物研究 AI基因组研究 03 入门 平台由项目管理、数据管理、作业、工具、开发环境、镜像等核心部件组成,各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。
查看评价指标:在模型列表页,单击某个模型名称左侧的按钮,可展示当前模型的相关指标,包括模型的数据量、描述、区间范围、评价指标、模型数据。 其中,评价指标的值代表了训练完成的模型在测试集上的好坏。 查看基模型 单击“基模型”,可以查看基模型列表。内置官方盘古药物大模型,在公测期间限时免费。 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
目,以及项目大小、项目成员角色、所有者、状态、是否核心项目、创建时间、更新时间和可执行的操作。 图2 项目列表 查看项目详情 项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。 查看项目概览 单击项目名称左侧图标,或双击项目行中的空白处,展开
图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。 项目存储量15分钟刷新一次,如果设置了项目最大存储量,项目数据达到最大存储量后,数据上传、复制、导入、执行的作业、notebook的使用会失败。 父主题: 项目管理
"workflow" }, "database_id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "database_name" : "demo-database" } ], "count" : 1 } 状态码
otebook与流程作业均在此资源池运行,其中Notebook启动用户为health-user,流程作业默认启动用户为root。 平台提供了必要的加固措施以保证容器安全、隔离性及数据安全,但由于容器技术本身的限制,仍可能存在容器逃逸等问题,进而导致越权访问。 为避免此类问题发生,
可以将多个应用编排入流程串联使用。 您可以在项目的应用列表中,查看隶属于该项目的应用,也可以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。 创建应用 应用是生物信息学软件的镜像封装
import file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 2021-02-01 11:11:27 Import row 2-4 of file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 下载数据作业执行日志 health
用来指定容器启动时的默认运行的命令,与CMD类似。区别在于:运行容器时添加在镜像之后的参数,对ENTRYPOINT是拼接,CMD是覆盖。 若在DockerFile中指定了容器启动时的默认运行命令为ls -l,则运行容器时默认启动命令为ls -l。 ENTRYPOINT [ "ls", "-l"]:指定容器启动时的程序及参数为ls