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String 作业依赖的组件id,组件当前仅支持流程,取值范围[1,135],支持大小写字母和数字。目前支持两种格式,特殊id:{流程名称}::{流程版本}::{源项目名称};正常id:流程id 最小长度:1 最大长度:135 tool_type 是 String 作业依赖的组件类型,仅支持填写workflow
资产id。长度1-128,只能包含字母、数字、下划线和中划线 最小长度:1 最大长度:128 asset_version 是 String 资产版本。长度1-128,字母或数字开头,后面跟小写字母、数字、小数点、斜杠、下划线或中划线 最小长度:1 最大长度:128 destination_app_name
String 目标应用名称 version String 应用版本 message String 导入结果信息,仅在导入失败时会返回 status String 导入结果状态 请求示例 导入流程,流程的名称为demo-workflow,版本为1.0.0。 https://eihealth.cn-north-4
删除镜像标签 使用rmi命令删除当前项目中指定镜像标签。 对于本项目的私有镜像tag会做彻底删除,即删除数据库记录及远程仓库中的镜像tag。 对于其他项目的导入镜像tag或者资产市场订阅的镜像tag仅删除导入或者订阅关系,即只删除数据库记录。 命令结构 health docker
表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布应用资产,资产名称为demo-app,版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1
资产id。长度1-64,只能包含字母、数字、下划线和中划线 最小长度:1 最大长度:128 asset_version 是 String 资产版本。长度1-128,字母或数字开头,后面跟小写字母、数字、小数点、斜杠、下划线或中划线 最小长度:1 最大长度:128 destination_workflow_name
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布流程,流程的名称为demo-workflow,版本为1.0.0。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com
创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目,单击“创建项目”按钮,填写项目名称以及选择对应的数据保护策略,数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
Id.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --v -v 否 按指定的对象名前缀批量删除多版本对象和多版本删除标记。 命令示例
目标应用名称 version String 应用版本 message String 导入结果信息,仅在导入失败时会返回 status String 导入结果状态 请求示例 导入应用,导入后应用名称为dest-demo-app,版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4
参数确认无误后,单击“立即创建”,创建应用。 表1 fastp、bwa_samtools应用参数说明 应用名称和版本 应用名称:fastp 版本:0.20.1 应用名称:bwa_samtools 版本:0.7.17 镜像和启动命令 镜像:fastp:0.20.1 启动命令: fastp --fix_mgi_id
输入参数,参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修改应用的一些参数或删除某些应用,则可以点击每个应用会出现对应的操作图标。例如单击会出现,下方图标分别对应的是修改,删除和复制操作。 构建好流程后单击右上角图标保存,然后关闭当前页面。 步骤3:新建作业 单击作业页面的“新
通过“功能模块”创建 在“功能模块”页面,选择对应的模块,单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面,配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”,在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”,在对应的模块页面配置详细信息,具体请参考功能模块。
描述信息 最小长度:0 最大长度:1024 name 是 String 镜像名称 最小长度:1 最大长度:128 tag 是 String 镜像版本 最小长度:1 最大长度:64 type 否 String 镜像类型。枚举值:APP、NOTEBOOK 枚举值: APP NOTEBOOK
Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1
修改流程 使用edit或update命令修改流程的内容,流程的名称和版本不支持修改。 命令结构 health edit workflow ID [flags] # edit和update作用相同 health update workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数
-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20
模板管理 从其他项目导入模板 上传模板 查询模板列表 创建模板 查询模板详情 删除模板 父主题: 数据库管理
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布数据资产,数据资产名称为eihealth-asset,版本为1。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v
作业的基本配置信息,以yaml文件导出,包含作业名称,依赖的workflow名称/版本,基本的CPU/Memory配置,输入输出参数等信息。 作业的运行信息,包括每个任务的启动、停止时间、运行状态,日志链接等。 在作业对应的操作列中,单击“更多 > 导出”,导出单个作业的元数据信息。勾选多个