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受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB、PDBQT格式。 图3 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库模板：使用资产市场订阅的流程时，模板已预置，无需选择数据库模板。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为
RECTORY，ENUM] pattern String 提示用户参数填写的格式，取值范围：[0-64]。对于STRING类型，匹配字符串内容，比如后缀约束.fastq；对于ENUM类型，可以提示一定要在param_enum列表范围内取值；对于FILE类型，约束文件后缀类型；对于
在“资产市场”中查找“Docking Summary”流程。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用Docking Summary流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。 步骤3：创建分析作业
否 Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。 最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0 - 10 custom_databases 否 Array of strings 可供搜索分子的自定义数据库id列表。 最小长度：1 最大长度：128 数组长度：0
import file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 2021-02-01 11:11:27 Import row 2-4 of file lmx-test-01:/lmx-database/data1.txt 下载数据作业执行日志 health
config_files Array of strings 作业标签 config_context String nextflow config文件内容 表4 NextflowParamsDto 参数 参数类型 描述 name String 参数名 最小长度：1 最大长度：1024 value
CTORY，ENUM] pattern 否 String 提示用户参数填写的格式，取值范围：[0-64]。对于STRING类型，匹配字符串内容，比如后缀约束.fastq；对于ENUM类型，可以提示一定要在param_enum列表范围内取值；对于FILE类型，约束文件后缀类型；对于
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CSS常见问题 如果子用户看不到“CSS资源列表”，需要授权子用户CSS权限。 如果在创建和追加数据库的过程，显示资源不足，需要扩容CSS集群。 若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。
最小值：1000000000000 最大值：9999999999999 key_word 否 String 关键字，支持在display_info字段中内容的模糊搜索。 最小长度：0 最大长度：128 sort_dir 否 String 排序规则，目前默认时间降序。 缺省值：DESC sort_key
SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
的使用情况、购买记录以及购买套餐包，也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源，此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源，购买步骤参考购买资源，绑定具体操作如下： 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法，将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择
参数 参数类型 描述 smiles String 分子SMILES表达式 databases Array of strings 搜索使用到的数据库集合 top_n Integer 期望最大返回条目数（排序后取Top） 最小值：1 最大值：1000 表5 SearchResult 参数
购买计算资源（主账号操作） 计算资源说明 资源看板 计算资源 存储资源 性能加速（可选） 数据库（可选）
标签页面管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。 数据管理 数据管理 数据归档、数据管理等相关操作API。 数据库管理 数据库管理 数据库管理、模板管理等相关操作API。 应用管理 应用管理 导入应用、创建应用、获取应用详情、删除应用等相关操作API。 流程管理 流程管理
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