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[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 描述 --ids -i 否 要导出的id列表,使用job-id导出作业时必选。 job-id 无 否 作业id。 导出多个job-id时,用分号(;)隔开。 格式:id1;id2;id3。 --file -f 否 要导出的id列表文件,使用job-id文件导出作业时必选。
基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
创建数据库 创建数据库 数据库支持使用.csv、.txt、.vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。
取值范围:输入字符最大长度为255 最大长度:255 database_id 是 String 自动作业依赖的数据库ID 最小长度:1 最大长度:128 database_column 是 String 自动作业状态更新列 最小长度:1 最大长度:55 database_column_type 否 String
最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 实例总数 databases Array of DatabaseDto objects 实例详情列表 表4 DatabaseDto 参数 参数类型 描述 id
数据库管理 数据库简介 创建数据库模板 导入数据库模板 创建数据库 引用数据库 管理数据库 父主题: 用户指南(基因平台)
登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口 在“我的凭证”页面中选择“访问密钥”页签。单击“新增访问密钥”,按操作指引获取认证账账号的AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。 图2 访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,
物研究和临床试验提供方向。 药物筛选通常分为靶点蛋白确定、候选药物小分子筛选、试验验证、临床验证四大阶段。 计算机辅助技术可以极快地加速前两个阶段,利用同源建模和分子动力学模拟,从病毒蛋白一级序列快速获得病毒蛋白3D结构,并且依托云端算力实现大规模筛选和成药性分析,从万级的小分子
登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口 在“我的凭证”页面中选择“访问密钥”页签。单击“新增访问密钥”,按操作指引获取认证账号的AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。 图2 访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,访
药物数据库管理 创建数据库 获取数据库列表 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 父主题: API(盘古辅助制药平台)
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模板管理 从其他项目导入模板 上传模板 查询模板列表 创建模板 查询模板详情 删除模板 父主题: 数据库管理
内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板填写好后,再使用命令行工具上传模板,创建流程。示例流程由app1和app2两个应用构成,通过指定输入、输出关系链接两个应用。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: name: 'demo-workflow'
o objects 配体相似度图任务结果对列表。 数组长度:1 - 100 表5 LigandSimilarityGraphTaskResultPairDto 参数 参数类型 描述 ligands Array of strings 两个配体名称。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:2
of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息列表 create_time String 创建时间 primary_key String 主键 is_prefab Boolean 是否是预置模板 表4 DatabaseColumnDto 参数 参数类型 描述
Built-in database {0} cannot be referenced. 检查id是否为预置数据库id。 400 eihealth.01040020 Duplicate databases are selected for referencing. 检查引用的数据库列表是否存在重复。
Score(有靶点)、Score、QED、SaScore Vina Score:代表分子如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序 Score:代表生成小分子的综合打分 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 图10 查看结果(2)
最大长度:128 database_name 是 String 数据库名称 最小长度:3 最大长度:32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度:0 最大长度:1024 output_file_type 是 String 生成数据库实例的文件类型。枚举值:csv、txt、vcf