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--current -c 否 同时使用project-name和--current,查询当前所在的项目详情信息。 --policy -p 否 查看项目的数据权限策略。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
系统级别用户管理 系统级的角色配置,可创建平台的子用户,并为其分配权限。详细介绍请参见用户管理。 项目级别用户管理 资源级的角色配置,以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组,以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详细介绍请参见项目管理。 表2 盘古辅助制药平台用户管理类型
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
开发环境(Notebook) Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题: 用户指南(基因平台)
填写套餐包的信息。 表1 参数说明 参数 说明 资源包类型 支持标准存储单AZ包、归档存储包。 标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。归档存储适合档案数据、医疗影像场景。详细可参考存储类别。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。
最小值:1 最大值:10 data_disk_spec_code 否 String 额外数据盘规格编码 最小长度:1 最大长度:64 data_disk_size 否 Integer 额外数据盘大小 最小值:100 最大值:32768 响应参数 无 请求示例 创建计算资源,指定可用区、规格,购买一台
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状态更新列的类型,不填默认为EXISTED clean_database_column
单击应用中的“qvina-w”,获取输出结果的路径。 文件的命名方式为:蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2 下载小分子构想数据 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
获取作业事件 获取作业日志 获取子任务启动事件 获取子任务实例信息 获取子任务中实例的事件 获取子任务中实例的pod信息 获取子任务中实例的资源监控数据 重试作业 取消或强制停止作业调度 批量取消作业 批量重试作业 批量删除作业 父主题: 应用管理
--description -d 否 作业的详细描述信息。 --input -i 否 输入参数名称,该参数与流程中的输入参数对应,通过修改--input,修改输入数据。 选择时,input和input-file二选一。 作业运行时,每个应用称之为一个task,应用可以设置多个输入参数,一个输入参数可以设置多个输入值。
开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。 项目存储量15分钟刷新一次,如果设置了项目最大存储量,项目数据达到最大存储量后,数据上传、复制、导入、执行的作业、notebook的使用会失败。 父主题: 项目管理
状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 数据对象(目录,文件)总数量 datas Array of TraceDataRsp objects 数据对象列表 bucket_size Long 桶存量 表5 TraceDataRsp 参数
设置GPU大小。 内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。
JupyterLab”,然后选择“Terminal”,进入Terminal界面。 图5 Terminal 例如,您可以执行wget命令在公开数据集中下载基因组测序数据。 图6 执行命令 父主题: 开发环境(Notebook)
参数类型 描述 smiles 是 String 分子SMILES表达式 databases 是 Array of strings 搜索使用到的数据库集合 top_n 否 Integer 期望最大返回条目数(排序后取Top) 最小值:1 最大值:1000 响应参数 无 请求示例 创建一个分子搜索任务
响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 节点标签数量 labels Array of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 https://eihealth
检查输入url是否正确。 400 eihealth.03001002 invalid task data 根据错误详细信息中提供的信息检查任务数据。 父主题: 附录
databases Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:0 - 10 custom_databases Array of strings 可供搜索分子的自定义数据库名称列表。 最小长度:1 最大长度:128 数组长度:0
响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 节点标签数量 labels Array of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 获取计算资源标签集 https://eihealth