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单击“查看3D”可以看到小分子和靶点的对接构象。 图7 查看3D 单击配体对比，可以计算对接后的构象与输入小分子的RMSD值和输入小分子和靶点的相互作用2D图。 图8 设置配体对 图9 配体对接结果图 单击查看2D相互作用图，可以看到对接后的小分子构象与蛋白的2D相互作用图，并且支持相互作用2D图下载。
Similarity：代表优化后的分子与原始分子的相似度。 QED：代表分子的成药性。 SaScore：代表合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。 图13 查看结果（2） 单击“查看3D”，可以看到分子的3D构象，如果设置了靶点，还可以看到优化后的小分子与靶点的结合构象。 如果上传了双靶
数据管理 如何获取AK/SK 几种不同类型的归档，区别是什么
聚类分析 目前靶点口袋分子设计返回的结果小分子数较多，无法进行批量分析，通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游的分子优化、合成路径规划等。 在输出结果页面左上角单
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题： 功能模块
基因组数据生成的参考基因拷贝数分布为参考基线，能够自动的完成输入数据的比对排序，以及拷贝数分布计算，并输出可视化图表以供查看。 我的发布 在“资产市场>我的发布”中可以查看该用户所有发布资产的情况。对于发布成功的资产，可以在“组织共享”中查看和订阅。 对于发布成功的资产，可以进行
生成后的小分子在满足强约束条件的基础上，会根据满足弱约束条件的权重总和以及与参考小分子的相似度来打分并进行排序。在初始化权重的基础上，每个约束所占的权重，会在每一轮的分子生成迭代中，根据所满足的约束来进行动态调整。比如说约束条件1，在分子生成迭代中比较容易满足，那么该条件的权重会
API（盘古辅助制药平台） CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI作业管理
accessibility score，合成可及性分数，旨在评估分子的合成难易程度。 结果解释：大于等于6为较难合成，小于6为较易合成。 SCscore： Synthetic complexity score，合成复杂度分数。 Fsp3： 碳饱和度，旨在评估分子的空间结构复杂度。 结果解释：大于等于0
单击受体结合能框，跳转到单受体对多配体的结果表页面，可以下载全量及单条CPI预测结果。 如果需要下载多个结果，可以选择结果后，单击左上角的“下载”。如果需要下载单条数据，单击数据操作列的“下载”即可。 下载操作将会产生流量费用，具体可参考计费说明。 单个受体对多个配体的结果页面有列表视图、卡片
作业投递后处于运行中，但是无日志打印，也没有任何符合预期的输出文件生成。 排查思路 首先需要用户自行确认一下投递的作业是否会在控制台打印日志，如果是有重定向日志输出到具体文件的话，此处无日志为正常现象。 子任务的事件中，确认作业子任务的实例是否有正常创建。 图2 子任务的事件 查看实例的事件，查看实例是否有正常创建。
MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy Minimization：能量最小化的步数，范围支持0<步数≤50000，默认是10000步。
初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 快速入门 关键概念 使用流程 初始化数据盘 什么是ECS 创建容器应用基本流程 05 实践 基于EIHealth平台，搭建NGS流程，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进
对于获取用户Token接口，您可以从接口的请求部分看到所需的请求参数及参数说明。将消息体加入后的请求如下所示，加粗的斜体字段需要根据实际值填写，其中username为用户名，domainname为用户所属的账号名称，********为用户登录密码，cn-north-4为project的名称，获取方法请参见获取用户名、账号名和项目name。
“神农项目”是完全免费公开的新冠药物虚拟筛选数据库。在抗疫期间，为了寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式，华为云医疗智能体项目团队联合多家科研机构，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进
蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取靶点蛋白的3D结构，对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，让研究人员可以同时从21个蛋白的角度，综合、无偏地评估药物效果，从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用
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