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数据归档成功后,可以在“归档”页面查看归档记录,并进行恢复、删除操作。归档恢复时,您可以将数据恢复至本项目或有权限的其他项目。 数据归档成功后,选择“归档”页签。 图10 选择归档页签 选择需要恢复的数据,单击操作列“恢复”。在恢复归档数据页面,选择需要恢复数据的位置和数据。
单击项目名称,在项目页面选择“设置”。 在项目详情页面,单击“已用存储量”后面的。 图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。
单击“导入流程”,进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项,可以使用原有名称,或自定义。 图2 导入流程 单击“确定”,导入流程。 父主题: 工具管理
新建流程 单击“新建流程”,进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具,详细介绍请参见流程设计器。新建流程时,自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息,填写完成后单击“确定”。
运行作业 方式1:使用预置的NGS流程 方式2:使用预置应用搭建NGS流程 方式3:自定义镜像运行FastQC流程
图3 重置用户信息 重置密码 最终租户在用户管理页面,可以重置用户的密码。在用户操作列,单击“重置密码”,重置用户的密码信息。 图4 重置密码 父主题: 用户管理
单击右上角的“Open JupyterLab”,可直接打开此Notebook实例对应的JupyterLab页面。 图1 进入JupyterLab 进入JupyterLab页面后,自动打开Launcher页面,如下图所示。
数据上传成功后可以在数据详情页面查询,创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询,复制其镜像地址填入Nextflow脚本中的container字段即可。
eihealth-projects/{eihealth_project_id}/nextflow/jobs/{job_id}/tasks 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看
操作步骤 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口 在“我的凭证”页面中选择“访问密钥”页签。单击“新增访问密钥”,按操作指引获取认证账号的AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。
在页面上方单击“镜像”,进入镜像管理页面。 单击镜像名称,进入镜像详情页。在该页面查看“源项目”、“镜像名称”、“镜像版本”,按照以下规则拼接出应用配置模板中的image参数。
图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列,单击“安全设置”,重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额。在用户操作列,单击“配额设置”,设置用户资源配额。
tar.sha256 Linux AMD 64位 health-linux-x86_64.tar、health-linux-x86_64.tar.sha256 macOS health-macOS-x86_64.tar、health-macOS-x86_64.tar.sha256 本页面命令行工具下载后
初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。
成员管理 在成员管理页面可以添加或者移除访问该项目的成员。
配置命令行工具 步骤1:获取认证信息 步骤2:获取命令行工具 步骤3:初始化配置
获取项目 使用get命令获取当前用户有权限访问的所有项目列表,以及项目信息,包含项目名称、ID、所有者、项目角色、存储大小、状态、创建时间、更新时间。 在使用该命令前,您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags
图1 新建作业 单击“确定”,进入启动作业页面。 (可选)在启动作业页面,可以通过,添加作业相关参数。 上传参数的模板可以通过单击进行下载。 如果流程设置了参数,作业上传的参数将会覆盖流程设置的参数。 单击“启动作业”。 父主题: Nextflow
eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id}/events 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看
设置邮箱接收消息范围 在平台右上角用户名中选择“个人设置”,进入邮箱消息通知设置页面。设置邮箱消息的接收范围和接收类型。 接收范围 仅自己接收操作:自己所执行的操作。如果选择此项,接收类型默认全选。 全部接收:自己有权限访问的项目中产生的操作,包含自己和其他项目成员所执行的操作。