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k（在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open Babel），详细步骤如下所示： 步骤1：安装容器引擎 步骤2：获取Notebook基础镜像 步骤3：制作并上传镜像 步骤4：创建并使用Notebook 步骤1：安装容器引擎 在制作自定义镜像时，您需要准备一台安装有Docker的
path>方式列举，project-name必须是已经引用了的，要求path格式是绝对路径。如果path是文件夹，则后面要加/标识。当cd到其他项目路径时，如果要查看本项目内容，使用绝对路径即可，如：health ls /abc/。 --limit -l 否 列举查询结果的最大个
流程创建成功后，您可以对流程进行编辑，删除操作。 编辑 选择已创建成功的流程，单击操作列的“编辑”，进入流程编辑页面。除了流程名称不能更改，您可以修改已有流程的其他参数配置项。 删除 通过单击操作列“删除”，可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。 MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
从头生成：通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后，上传靶点结构，并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 单击下一步，配置配体文件，支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体：选择靶
构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件；文件大小不超过5G；小分子支持10-10
在添加数据页面，上传待分析数据。 数据上传成功后，单击“确定”。 上传文件大小不能超过1GB。最多不能超过20个文件。 复制数据 将其他项目或本项目的数据，复制到本项目中，并可在本项目中操作该数据。 单击数据中心右上角“复制”。 选择需要复制的项目数据，选择导入数据的路径。 您可以选中多个文件夹进行批量复制。
使用create app命令引用本地的配置文件，创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d
在添加数据页面，选择“上传”，上传待分析数据。 数据上传成功后，单击“确定”。 上传文件大小不能超过1GB。 复制数据 将其他项目的数据，复制到本项目中，并可在本项目中操作该数据。 单击“添加数据”，类型选择“复制”。 选择需要复制的项目数据，选择导入数据的路径。 您可以选中多个文件夹进行批量复制。
使用create workflow命令引用本地的配置文件，创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description
获取供应商logo和名称设置 使用get命令获取供应商logo和名称配置，默认将供应商logo图片下载到本地路径。 命令结构 health get vendor-config [flags] # 其中vendor-config可简写为vc 命令示例 本节以Windows为例介绍e
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题： 系统管理
EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter Notebook使用文档。
机字符。 消息头：发送邮件时，邮件标题。 语言：选择中文或英文。 删除邮箱后，将不再发送邮件通知。 图1 邮件配置 邮箱配置完成后，单击“测试”，验证配置是否有误。配置成功后将在邮箱中收到测试通知。 图2 邮箱测试通知 收到邮箱测试通知后，单击“更新”，完成邮箱设置。 设置邮箱接收消息范围
步骤4：查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。配置信息导入后，即可查询命令行工具支持的操作，并执行相关命令，使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。 执行health
描述：参数描述，此参数为非必填项。 操作：可以单击操作列“删除”，删除对应的参数。 图2 配置流程参数 参数配置完成后，单击“保存”。 流程创建成功后，单击“保存并启动作业”，或者在流程管理页面，单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面，配置作业的相关信息，具体可参考新建作业。 父主题： Nextflow
com/eihealth/admet:2.0.0' } 暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag， timeline， report,，trace配置，医疗智能体（EIHealth）平台会默认开启并且指定相关路径，会覆盖用户侧配置，可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www
分子生成基于盘古药物分子大模型，对初始数据集进行采样，多目标、多方向的快速生成新颖且与靶点蛋白亲和力高的化合物。 单击“分子生成”功能卡片，进入配置页面。 输入初始数据集，有两种输入方式： 选择文件：支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件；小分子支持10-10000个。如果没有初
-s 否 每个分段移动任务的段大小，单位：字节，取值范围是100KB~5GB，默认为配置文件中的defaultPartSize。 支持带容量单位配置，例如，配置1MB代表1048576字节。支持配置为auto，此时obsutil会根据源对象大小自动设置每个分段任务的段大小。 --cpd
failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024，可在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。
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