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自定义数据库 盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库,可以上传自己的数据构建自己的数据库,进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源,详情见资源中心 自定义数据库 返回主页,单击“自定义数据库”进入界面,单击页面左上角的“创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。
单击“创建集群”。 图1 创建集群 基础配置:选择“计费模式”、“当前区域”。 集群类型选择“Elasticsearch”,输入集群名称。 图2 基础配置 节点规格:参考自己的数据库大小。自定义数据库所需要的的CSS节点规格大于“4 vCPUs | 8GB”,不支持“4 vCPUs
束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array of strings 参数取值 如填写,只支持填一项,根据参数类型进行不同的校验
束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array of strings 参数取值 如填写,只支持填一项,根据参数类型进行不同的校验
盘古辅助制药平台支持用户创建AI模型,目前AI模型只有专业版支持。AI建模支持创建属性模型和基模型。创建属性模型是基于自定义数据,对盘古药物分子大模型进行微调,进行属性预测和迭代活性优化,实现干湿实验闭环。基模型基于自定义化合物数据,对盘古药物分子大模型进行增量预训练,提升化合物表征精度。 登录盘古辅助制药平台,选择“AI模型”。
WeakConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct
WeakConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name 否 String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type 是 String 属性约束类型。 枚举值: bool range
WeakConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 id 否 String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name 否 String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type 是 String 属性约束类型。 枚举值: bool range
WeakConstraintDto 参数 参数类型 描述 id String 自定义模型id,仅弱约束为模型时填写。 最小长度:1 最大长度:128 name String 属性名称。 最小长度:1 最大长度:128 type String 属性约束类型。 枚举值: bool range struct
optimization_mode 否 String 优化类型。 枚举值: generation side_chains_decoration scaffold_hopping fragment_growing 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String
CustomProp 参数 参数类型 描述 id String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition PropDefinition object 属性定义的元信息 表8 PropDefinition 参数 参数类型 描述 id String
填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。 标准存储:适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储:适合长期存储,平均一年访问一次。 说明: 归档存储的费用为单独计费。
参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 header
MoleculeConstraint 参数 参数类型 描述 name String 属性名称 type String 属性约束类型 枚举值: bool range struct minimize maximize bool Boolean 属性约束类型bool的参数 range Array
查看执行结果 分析作业的执行时间与环境资源类型、环境资源大小、处理数据大小等相关。您可以在“作业”页面查看执行结果或进行操作。提供了作业的执行状态的查看,并可对作业执行取消、删除、重试、克隆、导出操作。勾选多个作业,可以批量取消、批量删除、批量重试、批量导出。 作业执行状态如下所示。
MoleculeConstraint 参数 参数类型 描述 name String 属性名称 type String 属性约束类型 枚举值: bool range struct minimize maximize bool Boolean 属性约束类型bool的参数 range Array
参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 num_trials
单击应用图标,弹出编辑图标,单击按钮,设置应用参数。 在“高级参数”下面可以设置加速类型。如果作业加速类型选择“无”,task加速类型可以任意选择。如果作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速,则此处task加速类型无法设置。 参数确认无误后,单击页面上方“启动作业”按钮,可以直接基于该流程创建自动分析作业。
fig 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String
参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String 用户 token 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 smiles