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能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源,购买步骤参考购买资源,绑定具体操作如下: 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。 单击“绑定”进入绑定界面,选择要绑定的CSS集群名称、填写管理员账户名和管理员密码。
用户每次恢复归档数据,按照流量收取费用。 用户的归档存储类型的归档数据不足90天删除,需收取相应费用,费用参照OBS存储费用。 用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档复制完成时间开始
管理用户 删除子用户 管理员用户包含子管理员,均具备删除权限。但子管理员不可将管理员删除。删除用户只能删除来源为本平台的用户,如果来源为IAM,则只支持移除。 在用户的操作列,单击“删除”,删除对应的用户。 图1 删除子用户 移除子用户 导入的用户,不支持删除,只支持移除。移除后
上海一,区域名称为cn-east-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”,获取平台ID。 图3 个人设置 图4 平台ID 父主题: 配置命令行工具
通过“数据”页面上传数据,支持上传最大为1GB的单个文件。 使用命令行工具上传 命令行工具(eihealth-toolkit)配套EIHealth平台,提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用,支持上传最大为48.8TB的单个文件。 父主题: Notebook
除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作均为系统的异步任务,您可以在“数据作业”中查看任务的执行状态。同时,平台针对该类任务支持您在“数据中心 > 数据作业”中查看任务的执行信息。在数据作业页面,支持通过作业类型、状态、创建时间、完成时间来进行搜索。
自定义数据库 盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库,可以上传自己的数据构建自己的数据库,进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源,详情见资源中心 自定义数据库 返回主页,单击“自定义数据库”进入界面,单击页面左上角的“创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。
上传文件夹时,只上传该文件夹下的所有内容,上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小不与平台文件大小一致。 文件的最后修改时间不一致。 --parallel -p 否 上传文件时,每个分段上
方式1:使用预置的NGS流程 使用EIHealth平台预置的流程进行运行作业。 步骤1:订阅流程 进入资产市场订阅已有的流程,以二代基因测序数据的变异检测流程为例。 图1 订阅流程 可以在“工具 > 流程”列表可以看到刚刚订阅的流程。 图2 查看订阅的流程 步骤2:订阅数据 若您
--password 是 密码。 --region 是 服务区域名称。请依据实际购买平台的区域填写。当前支持华北-北京四(cn-north-4)、华东-上海一(cn-east-3)。 --platform-id 是 平台ID,获取方法请参见步骤1:获取认证信息。 方法2:使用AK、SK初始化
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地,此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中,受网络影响可能出现损坏,下载命令默认会在下载完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
创建项目 您可以创建一个新的项目。 在平台左上角单击项目名称,选择“创建新项目”。 图1 创建新项目 配置项目信息。 表1 参数说明 参数 说明 项目名称 项目名称。取值范围3~45个字符,包含数字、小写字母、下划线、中划线,且只能以小写字母数字开头结尾。 项目创建成功后,不支持修改名称。
使用docker push命令将镜像上传至EIHealth平台。 # –t APP 可不加,在平台上也可以对其进行设置 health docker push user-tutorials/fastqc:latest –t APP 上传成功后,可以转至平台查看已经上传的镜像。 步骤3:创建fastqc应用
能对结果进行收藏,以下以分子对接模块为例,其他模块的收藏操作可在相应模块的介绍中查阅,请参考功能模块。 登录盘古辅助制药平台。 单击“进入平台”,进入药物平台操作页面。 单击“功能模块 > 苗头化合物发现 > 分子对接模块”,进入分子对接配置页面。 根据分子对接章节完成参数配置。
、临床研究三个领域提供专业AI研发平台。 产品介绍 用户指南 仅两个按钮时选用 立即使用 成长地图 由浅入深,带您玩转EIHealth 01 了解 医疗智能体(EIHealth)面向基因组分析、药物研发、临床研究三个领域,提供专业的AI研发平台,让科研过程标准化、可执行。 产品介绍
ix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1
修改流程 功能描述 修改指定workflow内容(名称不支持修改)。 命令结构 health nextflow edit workflow ID [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地work
若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。 在平台侧需要解绑并重新绑定。 CSS资源到期。 在云搜索服务的集群管理列表页,找到需要续订的计费模式为“包年/包月”的集群。 单击操作列的“更多
引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建作业,并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。
表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --domain-name -d 是 与管理员(购买平台的账户)的账号名一致。 --user-name -u 是 子用户的用户名。 管理员(购买平台的账户)登录时,user-name和domain-name一致。 --password -w