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rss Long process实际内存大小 peak_vmem Long process虚拟内存峰值 peak_rss Long process实际内存峰值 syscr Long 系统调用次数 syscw Long 系统调用次数 vol_ctxt Long 自愿上下文切换数 inv_ctxt
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 dev_user_pool Boolean notebook是否使用专属资源池 has_dev Boolean 是否集成开发环境 has_drug Boolean 是否部署药物虚拟筛选
图2 输入分子 单击“下一步”,进入靶点设置,此步骤为可选步骤,如果需要设置靶点,并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化,需要进行配置。最多可添加2个靶点。在添加靶点后,会进行单分子预对接,可查看Top1的对接打分与构象。
支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。
苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题: 功能模块
通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子生成。
API(盘古辅助制药平台) CSS集群管理 药物通用接口 药物数据库管理 药物作业管理 自由能微扰作业管理 分子对接作业管理 分子合成路径规划作业管理 分子优化作业管理 靶点口袋发现作业管理 靶点口袋分子设计作业管理 分子属性预测作业管理 分子搜索作业管理 分子生成作业管理 CPI
输出指定蛋白口袋的位置及大小,用于分子对接。 导出不同分辨率的图片文件。 播放与制作分子动力学轨迹动画。 父主题: 通用工具
可以单击”下游分析”,将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 单击口袋列表的,可以收藏靶点口袋发现结果,收藏后可在收藏夹页进行查看。 图2 查看靶点口袋发现结果 图3 查看靶点口袋发现运动轨迹 查看2D相互作用图。
√ √ Nextflow 启动、停止、重试、创建、更新、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 开发环境 创建、导入 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 启、停 √ √ √ - - 数据库 创建、导入、删除 √ √ √ - - 查看 √ √ √ √ √ 药物虚拟筛选
根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容 将传入的蛋白和小分子拼接成复合物结构 单分子文件格式转换 创建分子或分子复合物批量下载任务 查询分子或分子复合物批量下载任务详情 受体预处理(Fasta格式) 单分子预对接
Docking Summary 对一组小分子化合物配体和一组蛋白受体进行分子对接,汇总分子对接结果,用于可视化展示。
请检查电话号码是否正确。 400 eihealth.01010054 This phone number has been used 请更换一个电话号码。 400 eihealth.01010055 Invalid password.
单击“下游分析”,将聚类之后的不同构象进行分子对接。 单击每一个Model的按钮,查看构象。 单击每个Model的按钮,可以收藏构象,收藏后可直接在收藏夹页查看。
缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
engine 否 String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type 否 String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
engine 否 String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type 否 String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
该平台直接对接人体样本的RNA二代测序原始数据,具有对数据全自动质量控制、拼接和病毒组成分析等功能,实现了对样本中可能存在的包括新型冠状病毒在内的各种病毒的快速检测,并在线分析各种病毒的相对载量。
engine String 对接引擎,支持DSDP、AUTODOCK_VINA。 缺省值:AUTODOCK_VINA 最小长度:0 最大长度:15 docking_type String 对接类型,支持BLIND_DOCKING、POCKET_DOCKING。
Vina Score1 分子优化如果添加了靶点,将会计算对接结合能,并按照Vina Score进行排序,Vina Score Top1分数。