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系统设置 用户管理 资源中心 标签管理 个人设置 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
用户权限介绍 表1 用户权限说明 用户类别 权限 最终租户 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、邮箱和手机号、重置密码、移除用户。 系统管理员 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、移除用户。 非系统管理员 无相关编辑权限。 父主题: 用户管理
功能模块 靶点发现 苗头化合物发现 先导化合物优化 通用工具 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
苗头化合物发现 分子对接 分子属性预测 分子搜索 CPI预测 分子生成 父主题: 功能模块
先导化合物优化 分子优化 靶点口袋分子设计 自由能微扰 合成路径规划 父主题: 功能模块
用户指南(盘古辅助制药) 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
请求示例 创建分子对接作业,作业名称为demo-job, 受体文件为project:/dir/file,口袋中心位置的值为[0,0,0],口袋尺寸大小为[10,10,10],去除受体的水分子。
通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”,在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”,在对应的模块页面配置详细信息,具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作业,作业的参数及流程一并克隆到新作业中。 在“作业中心”页面,单击作业操作列的“克隆”。
以下操作步骤是在“数据中心”页面下载数据至本地。 在“数据中心”页面,下载数据至本地。 选择待下载的数据,单击“操作”列“下载”即可。 或者单击“操作”列“下载为”,然后单击鼠标右键,选择“链接另存为”,下载数据。
最小长度:0 最大长度:10000000 表6 BoundBoxDto 参数 是否必选 参数类型 描述 center 是 Array of doubles 口袋中心坐标,x、y、z轴的坐标。
可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果。 单击按钮,可以收藏分子搜索结果,收藏后的结果可直接在收藏夹页查看。
可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题: 通用工具
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址,为用户私有数据中心时为项目路径,为公共数据场景时为obs地址。
数组长度:1 - 10 表7 DrugBoundingBoxDto 参数 参数类型 描述 center Array of floats 口袋中心坐标;x, y, z轴的坐标。
单击数据中心右上角“URL导入”。 单击“添加URL”,填写URL地址。 选择需要导入数据的文件夹。 单击“确定”,导入数据。 图5 使用URL导入 父主题: 数据管理
最小值:0 最大值:20 响应参数 无 请求示例 设置口袋中心位置、大小和padding的值生成可渲染的口袋文件内容。
枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
在“作业中心”单击作业名称,在输出结果页面右侧口袋列表,单击口袋后面的图标,然后单击查看2D相互作用图即可。 图4 查看2D相互作用图 查看作业信息图。 在“作业中心”单击作业名称,单击“作业信息”页面。可以查看作业的参数和运行信息。 图5 查看作业信息图 父主题: 靶点发现