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{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建靶点优化作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。
--skip-lines -s 否 跳过的header行数,导入数据到数据库时此参数必填。 --delimiter -e 否 分隔符(;,\t),导入数据到数据库时此参数必填。 --files -f 否 导入文件列表,多个文件用分号(;)分隔,导入数据到数据库时此参数必填。
蛋白质FASTA序列 最小长度:4 最大长度:2048 smiles_list 是 Array of strings 分子SMILES表达式列表 threshold 否 Float 打分阈值,分值必须大于该阈值才会返回 num_results 否 Integer 期望最大返回条目数(
--parallel -p 否 上传文件时,每个分段上传任务数的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --jobs -j 否 上传文件夹时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --fr -R 否 上传对象时生成结果清单文件。
节点数下限 设置自动扩容的节点数下限。 取值范围为0-50。 CPU执行规则 设置CPU自动扩容的条件。 启用规则:默认开启。 触发条件:设置CPU分配率达到的条件,当满足设置的条件时进行自动扩容。取值范围:1-100。默认值:80。
files 是 Array of strings 导入文件l路径列表 最小长度:1 最大长度:1024 数组长度:1 - 5 delimiter 是 String 分隔符,常见分隔符为, ; 最小长度:1 最大长度:32 skip_lines 是 Integer 跳过的header行数
表6 SynthesisParamDto 参数 参数类型 描述 top_n Integer 期望最大返回条目数(排序后取TopN)。 最小值:1 最大值:50 max_search_depth Integer 预测路径的最大深度。
{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子搜索作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。
并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。
--parallel -p 否 上传文件时,每个分段上传任务数的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。 --jobs -j 否 上传文件夹时,批量任务的最大并发数,默认为5。取值范围[1,10]。
{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建分子属性预测作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。
{ "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1" } 创建CPI作业成功,当前运行作业数已达配额限制,此作业会等待。
String 蛋白质FASTA序列 最小长度:4 最大长度:2048 smiles_list Array of strings 分子SMILES表达式列表 threshold Float 打分阈值,分值必须大于该阈值才会返回 num_results Integer 期望最大返回条目数(
否 Integer 生成分子数量 strong_constraints 否 Array of 表4 objects 强约束集合 weak_constraints 否 Array of 表4 objects 弱约束集合 num_expected 否 Integer 期望最大返回条目数(
聚类分析 目前分子属性预测返回的结果小分子数较多,无法进行批量分析,通过一些聚类的辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证,提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架,来进行下游分析或者优化等。
strong_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 弱约束集合 num_expected 否 Integer 期望最大返回条目数(
--jobs -j 否 批量复制时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“?”
--jobs -j 否 批量移动时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 批量移动时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。批量移动时该参数可选。
--columns -c 否 当某个数据库实例列数非常多时,查看数据时会由于机器显示界面限制导致换行难以查看,添加此参数可以只显示想要查看数据的列名,多个列名用分号隔开(;),只有在--data参数使用时才生效。 --project 无 否 指定项目名。
--parallel -p 否 每个分段上传任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultParallels。 --threshold -t 否 开启分段上传任务的阈值,单位:字节,默认为配置文件中的defaultBigfileThreshold。