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gene-assent:/DataSet/ 切换到引用数据的路径，例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据，使用health cd命令切换到该路径，并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径，切换到自己项目数据时，需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/
为空时，获取当前用户有权限访问的项目列表。 --current -c 否 同时使用project-name和--current，查询当前所在的项目详情信息。 --policy -p 否 查看项目的数据权限策略。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Li
--cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段复制任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或
--cpd -C 否 生成断点记录文件的文件夹，默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_checkpoint。 每个分段移动任务会产生唯一对应的断点记录文件并保存至该文件夹的copy子文件夹下，分段任务执行成功后，对应的断点记录文件会被自动删除；分段任务执行失败或
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。 例如，使用health
genomeagent镜像功能点介绍 此章节介绍genomeagent镜像的基本功能。 功能点1：自动生成任务计划、自动生成子步骤代码 功能点2：自动提交EIFlow代码任务 功能点3：报错时自动修正 报错时自动修正 报错时用户介入修正。 功能点4：特定步骤中断（人为or非人为），前序步骤状态继承，重新执行中断步骤
使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删，执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目，只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致，命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project <project-name>
行排序，页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据 您添加的数据属于您的内容，您应对您的内容的合法合规性负责，建议您根据对您可适用的法律法规，进行相应的脱敏、匿名、加密或其他符合要求的处理或采取相应保护措施，当您在复制或者引用数据的时候，需审视是否存在隐私数据，请谨慎操作。 上传数据方式
Console的本质为Python终端，输入一条语句就会给出相应的输出，类似于Python原生的IDE。 进入JupyterLab主页后，可在“Notebook”区域下，选择适用的AI引擎，单击后将新建一个对应框架的Notebook文件。 由于每个Notebook实例选择的工作环境不同
--update -r 列举路径中的对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。 列举本地路径中的文件夹对象时，需要使用“路径/文件名”或“路径\文件名”格式。请依据操作系统的路径规范使用，如示例中的D:\local。 如果路径中带有特殊字符比如（）之类的，运行的时候需要将整个路径用"
目成员具备相应的权限，不同类型成员所拥有的权限请参见成员角色和权限。 冻结：冻结项目。一个项目可能由于某些原因暂时中止，此时可以将项目暂时冻结，待下次重新启动时再激活。处于“冻结”状态的项目，用户无法进入该项目查看项目的开发环境、流程等历史运行情况，当前正在运行的分析作业会继续执
消息中心用于所有用户的异步任务场景下的事件处理通知和系统通知，如项目删除、数据删除、数据导入、流程执行完成等，给予状态通知。 单击平台右上角图标，在弹出的“消息中心”中查看异步任务的操作记录和系统通知。 系统通知 在系统通知页签，可以查看系统通知的内容、时间。单击某个消息，可查看消息的详细内容
项目进行资源的访问、共享和协作。 预置流程：预置流程包括NGS、GATK、Cell Ranger和Druglikeness。 项目间资产共享：实现跨项目数据、应用、流程的使用。 开发环境：预置基因组自动建模工具AutoGenome，提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。
欢迎使用盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台是以盘古药物大模型为基础打造的一站式药研平台，助力药物研发效率提升60%+。平台提供靶点发现，苗头化合物发现，先导化合物优化全流程药研所需功能。同时基于云原生的软硬件一体化加速，大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。 全平台无需软硬件
获取notebook详情 更新notebook 删除notebook 启停notebook 获取notebook鉴权信息 获取notebook工作环境 父主题： notebook开发环境
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
发环境、镜像等核心部件组成，各个部件沉淀了丰富的技术细节和人性化的设计。 初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
数据库管理、模板管理等相关操作API。 应用管理 应用管理 导入应用、创建应用、获取应用详情、删除应用等相关操作API。 流程管理 流程管理 导入流程、创建流程、获取流程详情、删除流程等相关操作API。 作业管理 作业管理 启动作业、获取作业详情、停止作业等相关操作API。 资产市场 资产市场
ix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务，参考步骤1
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